128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5034 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  100 
 
 		 572 aa  1180    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  30.75 
 
 		 680 aa  223  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  24.46 
 
 		 580 aa  87  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  24.78 
 
 		 583 aa  78.6  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  22.13 
 
 		 565 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  23.36 
 
 		 593 aa  73.6  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  23.4 
 
 		 634 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  22.18 
 
 		 595 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  23.3 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  23.08 
 
 		 571 aa  67.4  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3452  hypothetical protein  30.91 
 
 		 519 aa  65.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2274  AAA ATPase  22.95 
 
 		 602 aa  65.1  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.363979 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1772  hypothetical protein  22.62 
 
 		 573 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755026  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1107  hypothetical protein  23.72 
 
 		 591 aa  59.3  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000952777  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0282  AAA ATPase  22.35 
 
 		 378 aa  56.2  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  27.45 
 
 		 428 aa  55.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  31.9 
 
 		 651 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  30.16 
 
 		 390 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  23.29 
 
 		 380 aa  51.6  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  22.92 
 
 		 363 aa  51.2  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.35 
 
 		 548 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  31.03 
 
 		 636 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  27.04 
 
 		 390 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0289  ABC transporter related  37.18 
 
 		 636 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  27.04 
 
 		 390 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  30.77 
 
 		 374 aa  50.4  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  21.36 
 
 		 465 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  29.33 
 
 		 395 aa  50.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  27.04 
 
 		 390 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  21.98 
 
 		 497 aa  50.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  27.04 
 
 		 390 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  22.91 
 
 		 363 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  37.31 
 
 		 240 aa  49.7  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  23.71 
 
 		 370 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  27.05 
 
 		 451 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  33.33 
 
 		 566 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  32.98 
 
 		 643 aa  49.7  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  40.38 
 
 		 623 aa  48.5  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  35.14 
 
 		 369 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  29.27 
 
 		 367 aa  48.9  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1109  ABC transporter related  35.29 
 
 		 303 aa  48.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  38.46 
 
 		 643 aa  48.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  24.92 
 
 		 334 aa  48.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  34.29 
 
 		 408 aa  47.8  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  30.56 
 
 		 253 aa  47.8  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.39 
 
 		 708 aa  47.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  33.33 
 
 		 636 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  27.2 
 
 		 392 aa  47.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  23.3 
 
 		 370 aa  47.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  35.21 
 
 		 633 aa  47  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  30.3 
 
 		 378 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  38.46 
 
 		 457 aa  47  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  28.77 
 
 		 387 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1475  ABC transporter, ATP-binding protein  27.36 
 
 		 291 aa  46.6  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000651776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  26.67 
 
 		 386 aa  47  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  33.33 
 
 		 636 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2495  hypothetical protein  37.84 
 
 		 630 aa  47  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  28.72 
 
 		 250 aa  47  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1404  ABC transporter-related protein  38.46 
 
 		 640 aa  47  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0880457  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  25.87 
 
 		 314 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69340  putative ATP-binding component of ABC transporter  34.62 
 
 		 638 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1957  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.63 
 
 		 326 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359693  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  29.29 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5997  ABC transporter ATP-binding protein  34.62 
 
 		 638 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148625  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  26.36 
 
 		 393 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0196  ABC transporter ATP-binding protein  34.29 
 
 		 636 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  29.29 
 
 		 634 aa  45.8  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  32.88 
 
 		 513 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3230  hypothetical protein  34.41 
 
 		 113 aa  46.2  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0080421  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  31.46 
 
 		 461 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0217  ABC transporter related  34.29 
 
 		 636 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631932  normal  0.82416 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  29.45 
 
 		 387 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  34.18 
 
 		 308 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  33.85 
 
 		 513 aa  45.8  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0220  ABC transporter related  34.29 
 
 		 615 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  29.17 
 
 		 253 aa  46.2  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  20.41 
 
 		 349 aa  46.2  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  33.65 
 
 		 388 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0221  ABC transporter related  34.67 
 
 		 252 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0289  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.92 
 
 		 288 aa  45.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0412656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  26.92 
 
 		 271 aa  45.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1310  ABC transporter related  31.25 
 
 		 622 aa  45.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  23.21 
 
 		 324 aa  45.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  29.45 
 
 		 387 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  29.73 
 
 		 258 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  23.03 
 
 		 495 aa  45.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1530  ABC transporter related  30.56 
 
 		 243 aa  45.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.429665  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  29.84 
 
 		 393 aa  44.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  27.38 
 
 		 346 aa  44.7  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0612  FeS assembly ATPase SufC  37.14 
 
 		 258 aa  45.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1102  hypothetical protein  31.82 
 
 		 411 aa  44.7  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.89522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0287  ABC transporter related  24.32 
 
 		 531 aa  44.7  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  26.92 
 
 		 410 aa  44.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04300  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  32.95 
 
 		 234 aa  44.7  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4928  Type I secretion system ATPase, PrtD  37.31 
 
 		 585 aa  44.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.33 
 
 		 647 aa  44.7  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1988  ABC transporter related  30.43 
 
 		 290 aa  44.3  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.854169  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  28.16 
 
 		 276 aa  44.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  34.78 
 
 		 244 aa  44.7  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  29.21 
 
 		 586 aa  44.3  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>