More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0612 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0612  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 		 258 aa  512  1e-144  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0177  FeS assembly ATPase SufC  83.6 
 
 		 252 aa  437  1e-121  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409985  normal  0.132248 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0760  FeS assembly ATPase SufC  84.4 
 
 		 254 aa  431  1e-120  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.107751  normal  0.952712 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1744  FeS assembly ATPase SufC  84 
 
 		 254 aa  431  1e-120  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1841  ABC transporter related  51.82 
 
 		 251 aa  261  8e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  47.39 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  46.03 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  44.13 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  42.91 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0516  FeS assembly ATPase SufC  47.39 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1259  FeS assembly ATPase SufC  46.25 
 
 		 244 aa  205  7e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000235228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1467  FeS assembly ATPase SufC  46.31 
 
 		 251 aa  204  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0406739  normal  0.0473468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  45.93 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  43.15 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  43.75 
 
 		 247 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0960  FeS assembly ATPase SufC  43.87 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  43.55 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  43.43 
 
 		 256 aa  202  4e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  43.55 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0656  FeS assembly ATPase SufC  44 
 
 		 257 aa  202  6e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  43.2 
 
 		 248 aa  202  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  43.75 
 
 		 253 aa  201  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2337  FeS assembly ATPase SufC  43.87 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  43.57 
 
 		 248 aa  201  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2592  cysteine desulfurase ATPase component  42.97 
 
 		 248 aa  201  8e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  43.57 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2436  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.49 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0558261  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2105  FeS assembly ATPase SufC  45.49 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147981 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1743  cysteine desulfurase ATPase component  42.57 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0361641  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  44.31 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  43.15 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  43.03 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1849  cysteine desulfurase ATPase component  42.57 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2457  FeS assembly ATPase SufC  44.86 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  44.9 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1898  FeS assembly ATPase SufC  45.08 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111846 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2327  FeS assembly ATPase SufC  44.31 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.486674  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1780  FeS assembly ATPase SufC  44.76 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  43.65 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2106  FeS assembly ATPase SufC  44.62 
 
 		 265 aa  199  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.118871  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  43.55 
 
 		 250 aa  198  6e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4458  FeS assembly ATPase SufC  43.62 
 
 		 250 aa  198  9e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236555 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  41.83 
 
 		 256 aa  198  9e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  44.18 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  43.62 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2067  FeS assembly ATPase SufC  42.75 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.962142  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4168  FeS assembly ATPase SufC  40.94 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1674  FeS assembly ATPase SufC  43.2 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.305783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  44.86 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  43.21 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0385  FeS assembly ATPase SufC  42.75 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.686208 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1848  FeS assembly ATPase SufC  43.6 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000939138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  43.5 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2254  FeS assembly ATPase SufC  45.08 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5108  FeS assembly ATPase SufC  43.21 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  40.89 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0051  FeS assembly ATPase SufC  42.98 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0644623  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5984  ABC transporter  45.93 
 
 		 257 aa  195  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1762  cysteine desulfurase ATPase component  43.2 
 
 		 248 aa  195  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129847  hitchhiker  0.0000268298 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  43.6 
 
 		 248 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  43.6 
 
 		 248 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  43.6 
 
 		 248 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3978  FeS assembly ATPase SufC  43.21 
 
 		 250 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.648444 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  43.6 
 
 		 248 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  43.6 
 
 		 248 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4346  FeS assembly ATPase SufC  43.21 
 
 		 250 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  44.63 
 
 		 249 aa  194  9e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0785  FeS assembly ATPase SufC  41.77 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00319351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0099  FeS assembly ATPase SufC  41.87 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.842965 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1114  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  42.74 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.539485  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  42.08 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16150  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  42.86 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1514  FeS assembly ATPase SufC  41.25 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1663  FeS assembly ATPase SufC  43.48 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.160524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1447  ATP-dependent transporter  41.25 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.629714  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0696  FeS assembly ATPase SufC  42.8 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.0776058 
 
 
-
 
NC_004310  BR0932  ABC transporter, ATP-binding protein  44.67 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13370  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  43.03 
 
 		 253 aa  192  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1415  FeS assembly ATPase SufC  44.86 
 
 		 246 aa  193  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  42.17 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2735  FeS assembly ATPase SufC  43.48 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0926  FeS assembly ATPase SufC  44.67 
 
 		 280 aa  193  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262969  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2266  FeS assembly ATPase SufC  42.46 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  41.8 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1984  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  44.49 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192658  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1143  FeS assembly ATPase SufC  42.69 
 
 		 253 aa  192  6e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5847  FeS assembly ATPase SufC  41.56 
 
 		 250 aa  191  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102923  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  42.5 
 
 		 254 aa  191  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0304  FeS assembly ATPase SufC  43.09 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.553044  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2445  FeS assembly ATPase SufC  43.03 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.0543991 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  40.17 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0697  FeS assembly ATPase SufC  43.62 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.85326  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  41.39 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2038  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  40.24 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2088  FeS assembly ATPase SufC  43.87 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.777422 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1461  FeS assembly ATPase SufC  45.85 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2553  FeS assembly ATPase SufC  42.46 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  41.39 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>