57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0144 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0144  ATPase  100 
 
 		 565 aa  1160    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  32.98 
 
 		 571 aa  330  6e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1772  hypothetical protein  32.59 
 
 		 573 aa  296  1e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755026  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  41.09 
 
 		 347 aa  249  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0282  AAA ATPase  32.98 
 
 		 378 aa  189  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  26.92 
 
 		 583 aa  172  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  26.07 
 
 		 580 aa  167  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  24.04 
 
 		 595 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2274  AAA ATPase  23.31 
 
 		 602 aa  93.6  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.363979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  25.41 
 
 		 572 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  24.04 
 
 		 680 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  22.06 
 
 		 593 aa  63.9  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  24.27 
 
 		 634 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2628  hypothetical protein  38.96 
 
 		 86 aa  55.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0280  hypothetical protein  24.07 
 
 		 281 aa  55.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  23.62 
 
 		 369 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  35.56 
 
 		 626 aa  52.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.4 
 
 		 647 aa  52  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  50 
 
 		 359 aa  51.2  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  45.61 
 
 		 641 aa  50.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  47.73 
 
 		 362 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  26.97 
 
 		 584 aa  50.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1483  ABC transporter related  25.41 
 
 		 255 aa  48.5  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3920  ABC transporter related protein  35.62 
 
 		 264 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.197933 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.93 
 
 		 578 aa  47.8  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  22.19 
 
 		 368 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1132  hypothetical protein  47.73 
 
 		 358 aa  47  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0249333  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0479  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33 
 
 		 315 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  39.47 
 
 		 427 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  30.59 
 
 		 648 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  31.33 
 
 		 416 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  40.35 
 
 		 619 aa  45.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0003  recombination protein F  36.92 
 
 		 379 aa  45.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0714428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  46.51 
 
 		 423 aa  45.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  28.21 
 
 		 441 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04060  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  26.45 
 
 		 259 aa  44.3  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0552358 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1107  hypothetical protein  21.6 
 
 		 591 aa  44.3  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000952777  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  38.64 
 
 		 663 aa  43.9  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  33.9 
 
 		 361 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  41.86 
 
 		 626 aa  44.3  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1102  hypothetical protein  41.86 
 
 		 411 aa  43.9  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.89522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0163  ABC transporter-like  30 
 
 		 333 aa  43.9  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  39.53 
 
 		 159 aa  43.9  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  30.69 
 
 		 519 aa  43.9  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  46.51 
 
 		 603 aa  43.9  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2206  ABC transporter related  29.07 
 
 		 271 aa  43.9  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  42.5 
 
 		 591 aa  43.9  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  37.78 
 
 		 390 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0121  ATPase-like protein  44.44 
 
 		 407 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188452 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  41.86 
 
 		 604 aa  43.5  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  42.22 
 
 		 388 aa  43.5  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0924  hypothetical protein  38.64 
 
 		 347 aa  43.5  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.281728 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  41.86 
 
 		 626 aa  43.5  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  37.78 
 
 		 390 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  37.78 
 
 		 390 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  42.86 
 
 		 605 aa  43.5  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  34.78 
 
 		 581 aa  43.5  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>