More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1483 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1483  ABC transporter related  100 
 
 
255 aa  512  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1426  ABC transporter related protein  58.57 
 
 
256 aa  289  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2845  ABC transporter related  57.25 
 
 
256 aa  288  6e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1374  ABC transporter-related protein  56.97 
 
 
259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5708  ABC transporter related  51.09 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.780398 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0892  ABC transporter ATP-binding protein  41.43 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0662461  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2553  ABC transporter related  45.92 
 
 
254 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.758455  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_29  iron ion ABC transporter ATP-binding protein  40.53 
 
 
248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3468  ABC transporter related  47.56 
 
 
265 aa  186  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.11 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  38.74 
 
 
260 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1286  sensor histidine kinase  37.71 
 
 
258 aa  176  3e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  42.37 
 
 
278 aa  176  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1170  ABC transporter related  41.6 
 
 
250 aa  176  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.842608  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.8 
 
 
322 aa  174  8e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  41.18 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1655  ABC transporter related  43.22 
 
 
252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339871  normal  0.278117 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  41.18 
 
 
265 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  45.68 
 
 
256 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  42.01 
 
 
257 aa  164  9e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  42.8 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  40.53 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  43.16 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  43.16 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  39.82 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1987  ABC transporter related  42.04 
 
 
261 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  35.42 
 
 
259 aa  157  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  38.43 
 
 
269 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.34 
 
 
269 aa  156  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  37.55 
 
 
266 aa  156  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  37.02 
 
 
277 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  36.36 
 
 
260 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  36.48 
 
 
277 aa  152  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1201  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  34.73 
 
 
257 aa  152  7e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  38.5 
 
 
256 aa  151  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  36.44 
 
 
266 aa  150  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  36.91 
 
 
253 aa  151  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  38.4 
 
 
263 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.4 
 
 
263 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5520  ABC transporter related  41.99 
 
 
261 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  0.195209 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  36.48 
 
 
253 aa  148  8e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  39.67 
 
 
272 aa  148  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  38.26 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3223  ABC transporter component  39.42 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2478  ABC transporter related  40.51 
 
 
266 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2736  ABC transporter related  41.41 
 
 
261 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0249  ABC transporter related protein  41.28 
 
 
252 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  34.85 
 
 
262 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  36.1 
 
 
276 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4650  ABC transporter related  41.81 
 
 
261 aa  142  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499061  hitchhiker  0.000876955 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  37.2 
 
 
271 aa  142  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  37.39 
 
 
268 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  34.32 
 
 
259 aa  142  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  37.39 
 
 
444 aa  142  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  35.65 
 
 
280 aa  142  7e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.21 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1949  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.64 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0406982 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1042  hypothetical protein  31.97 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.660345  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  36.91 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  34.82 
 
 
258 aa  139  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1615  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  30.23 
 
 
257 aa  138  7e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  32.11 
 
 
259 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3032  ABC transporter related  38.6 
 
 
256 aa  138  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1532  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  31.64 
 
 
257 aa  137  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  36.41 
 
 
290 aa  137  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  38.67 
 
 
254 aa  137  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  38.53 
 
 
269 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  36.28 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0280  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  38.71 
 
 
242 aa  136  4e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  38.6 
 
 
250 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1539  ABC transporter-related protein  35.16 
 
 
261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1071  ABC transporter related  34.18 
 
 
427 aa  133  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  36.25 
 
 
278 aa  133  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  33.33 
 
 
253 aa  133  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2006  ABC transporter related  37.77 
 
 
245 aa  132  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.105448  normal  0.245212 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  32.6 
 
 
254 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  33.33 
 
 
280 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2063  ABC transporter related protein  35.08 
 
 
260 aa  131  9e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  36 
 
 
255 aa  131  9e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  38.99 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1079  ATPase  33.06 
 
 
421 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  35.75 
 
 
275 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  31.09 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  35.34 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  38.5 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  37.18 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  32.92 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  42.86 
 
 
250 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0327  iron ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 
252 aa  130  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000461185  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2133  ABC transporter related  33.6 
 
 
256 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1183  ABC transporter, ATP-binding protein  33.02 
 
 
220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113445  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  33.2 
 
 
298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1122  ABC transporter related  33.47 
 
 
427 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.672598  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  32.92 
 
 
260 aa  129  6e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  36.78 
 
 
271 aa  128  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  38.65 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  33.05 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  35.84 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  31.25 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>