46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2704 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  100 
 
 
581 aa  1192    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1107  hypothetical protein  28.07 
 
 
591 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000952777  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  24.87 
 
 
593 aa  211  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.16 
 
 
708 aa  80.9  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  24.64 
 
 
580 aa  68.2  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2274  AAA ATPase  30.8 
 
 
602 aa  66.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.363979 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  25.09 
 
 
666 aa  65.1  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  24.71 
 
 
583 aa  64.3  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  25.5 
 
 
628 aa  62  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1772  hypothetical protein  22.87 
 
 
573 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755026  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.47 
 
 
652 aa  57  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  26.24 
 
 
595 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  19.4 
 
 
680 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  26.09 
 
 
506 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  30.53 
 
 
382 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  26.38 
 
 
566 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  22.15 
 
 
571 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  32.39 
 
 
382 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  32.39 
 
 
382 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  45.1 
 
 
454 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  23.95 
 
 
486 aa  48.1  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  33.33 
 
 
1159 aa  47.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  22.44 
 
 
373 aa  46.6  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  34.67 
 
 
364 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  22.26 
 
 
634 aa  46.2  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  40 
 
 
615 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  40.79 
 
 
1196 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  18.62 
 
 
385 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  25 
 
 
634 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  38.78 
 
 
391 aa  45.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  24.84 
 
 
522 aa  45.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  33.33 
 
 
390 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  32.18 
 
 
439 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.07 
 
 
578 aa  44.7  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  46.67 
 
 
1107 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  30 
 
 
450 aa  44.3  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3860  hypothetical protein  43.18 
 
 
345 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.925149  normal  0.074002 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  44.19 
 
 
615 aa  44.3  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  41.86 
 
 
604 aa  44.3  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  42.86 
 
 
384 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  40 
 
 
1207 aa  44.3  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  44.19 
 
 
647 aa  43.9  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  31.03 
 
 
789 aa  43.9  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  37.97 
 
 
1192 aa  43.5  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  21.07 
 
 
388 aa  43.5  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  34.78 
 
 
565 aa  43.5  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>