56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2919 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  100 
 
 
427 aa  849    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1645  ATPase  30.62 
 
 
451 aa  192  7e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0853  ATPase  32.06 
 
 
445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  30.33 
 
 
450 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  29.71 
 
 
446 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  31.71 
 
 
423 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  28.79 
 
 
457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  27.79 
 
 
448 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  29.49 
 
 
443 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  39.18 
 
 
976 aa  71.6  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  34.44 
 
 
455 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  36.9 
 
 
452 aa  64.7  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  24.94 
 
 
440 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3405  ATP-binding protein  37.39 
 
 
454 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00177365  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  43.84 
 
 
176 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  39.77 
 
 
228 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  44.16 
 
 
532 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1859  hypothetical protein  28.24 
 
 
464 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  34.78 
 
 
368 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  30.28 
 
 
251 aa  55.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1634  ATPase  40.3 
 
 
94 aa  53.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  30 
 
 
457 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  38.2 
 
 
416 aa  49.7  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  24.8 
 
 
437 aa  49.7  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  30.38 
 
 
556 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  28.5 
 
 
509 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1513  hypothetical protein  32.95 
 
 
444 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  31.03 
 
 
414 aa  47.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  23.48 
 
 
449 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  31.63 
 
 
541 aa  47.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  36.36 
 
 
584 aa  46.6  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  30.36 
 
 
670 aa  47  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.52 
 
 
672 aa  46.6  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  36.47 
 
 
353 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  38.81 
 
 
597 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  39.47 
 
 
565 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  41.54 
 
 
567 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  29.63 
 
 
451 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  29.55 
 
 
263 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  27.47 
 
 
430 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  24.64 
 
 
454 aa  45.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  25 
 
 
422 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  29.35 
 
 
276 aa  45.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  24.29 
 
 
423 aa  44.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  25 
 
 
458 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  20.89 
 
 
478 aa  44.3  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  23.48 
 
 
452 aa  44.3  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  34.41 
 
 
586 aa  44.3  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.66 
 
 
681 aa  43.9  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  27.5 
 
 
439 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  22.05 
 
 
482 aa  43.9  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  28.57 
 
 
533 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  29.63 
 
 
427 aa  43.1  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  26.09 
 
 
461 aa  43.1  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  24.72 
 
 
421 aa  43.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  35.29 
 
 
352 aa  43.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0363611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>