33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3577 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  100 
 
 
458 aa  932    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  26.18 
 
 
430 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  33.01 
 
 
446 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  32.29 
 
 
423 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  38.46 
 
 
410 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  27.21 
 
 
421 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0853  ATPase  29.13 
 
 
445 aa  50.1  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  29.79 
 
 
353 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  31.33 
 
 
368 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  30.21 
 
 
422 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  38.24 
 
 
336 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  36.49 
 
 
457 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  29.93 
 
 
406 aa  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  29.29 
 
 
352 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  37.1 
 
 
403 aa  47.4  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  36.62 
 
 
448 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  38.18 
 
 
464 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  28.95 
 
 
455 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  39.62 
 
 
464 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  30.1 
 
 
450 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  41.3 
 
 
440 aa  46.6  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  41.3 
 
 
439 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  29.29 
 
 
410 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  29.29 
 
 
461 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  42.55 
 
 
427 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  37.04 
 
 
203 aa  45.8  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1645  ATPase  29.63 
 
 
451 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  43.14 
 
 
769 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  27.17 
 
 
976 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  25 
 
 
427 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  33.33 
 
 
408 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  29.81 
 
 
423 aa  43.1  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  35.29 
 
 
422 aa  43.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>