172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1600 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1600  ATPase  100 
 
 		 427 aa  892    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  38.69 
 
 		 439 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  34.06 
 
 		 440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  33.61 
 
 		 454 aa  196  6e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  31.99 
 
 		 422 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  32.55 
 
 		 421 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  30.93 
 
 		 410 aa  182  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  31.2 
 
 		 442 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  28.48 
 
 		 478 aa  158  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  28.12 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  25.56 
 
 		 406 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  27.09 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  29.74 
 
 		 410 aa  113  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  26.84 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  26.48 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  26.94 
 
 		 423 aa  109  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  25.43 
 
 		 482 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  26.11 
 
 		 422 aa  103  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  27.15 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  26.73 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  48.11 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  49.46 
 
 		 449 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  47.62 
 
 		 203 aa  93.2  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  31.22 
 
 		 769 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  31.55 
 
 		 709 aa  89.7  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  24.71 
 
 		 736 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  38.32 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  23.24 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  26.3 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  35.04 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  37.61 
 
 		 577 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  23.31 
 
 		 464 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  35.48 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.12 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  38.95 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  38.3 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  28.36 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  27.51 
 
 		 532 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  27.56 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  34.52 
 
 		 608 aa  58.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  32.24 
 
 		 582 aa  57.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  30.1 
 
 		 610 aa  55.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  45.1 
 
 		 912 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  22.47 
 
 		 666 aa  53.5  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  36.08 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  37.04 
 
 		 352 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  35.16 
 
 		 1476 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  22.19 
 
 		 596 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  48.84 
 
 		 353 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  40.74 
 
 		 1222 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  42.31 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  40.74 
 
 		 1172 aa  47.4  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  40.74 
 
 		 1195 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  23.5 
 
 		 588 aa  47.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  44.64 
 
 		 607 aa  47.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  40.35 
 
 		 712 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  35.8 
 
 		 353 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1135  hypothetical protein  25.1 
 
 		 447 aa  47  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.879789  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0883  hypothetical protein  38 
 
 		 79 aa  46.6  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  29.81 
 
 		 530 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0003  recombination protein F  33.33 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0385213  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  42.55 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_242  predicted protein  23.42 
 
 		 1224 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0003  recombination protein F  35.29 
 
 		 357 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000748335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0034  recombination protein F  38.24 
 
 		 361 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000927918  normal  0.243305 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  40.35 
 
 		 368 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  34.48 
 
 		 687 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03583  recombination protein F  32.35 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.517201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.35 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.877523  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0398  recF protein  48.84 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  37.04 
 
 		 1186 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  38.89 
 
 		 1191 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30352  predicted protein  36 
 
 		 1213 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0003  RecF recombinational DNA repair ATPase  44.19 
 
 		 353 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0003  RecF recombinational DNA repair ATPase  44.19 
 
 		 353 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04180  nuclear condensin complex protein, putative  40 
 
 		 1215 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03527  hypothetical protein  32.35 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5128  recombination protein F  32.35 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.010515  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  35 
 
 		 922 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0003  recombination protein F  35.29 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  38.89 
 
 		 1199 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1507  SMC domain protein  33.77 
 
 		 1115 aa  45.8  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.44218  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4228  recombination protein F  39.53 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4064  recombination protein F  39.53 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  27.97 
 
 		 251 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  36.17 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  38.89 
 
 		 1198 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  37.04 
 
 		 1203 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3913  recombination protein F  32.35 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00221081  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4210  recombination protein F  32.35 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000837842  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0003  recombination protein F  35.29 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0110624  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  38.89 
 
 		 1198 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1722  SMC domain-containing protein  37.5 
 
 		 580 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198567  hitchhiker  0.0000514519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4048  recombination protein F  39.53 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  40.82 
 
 		 1196 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0003  recombination protein F  32.35 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0566679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4065  recombination protein F  32.35 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0837895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4225  recombination protein F  32.35 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.164466  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4121  recombination protein F  39.53 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.976477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4170  recombination protein F  39.53 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0248786  normal  0.357156 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>