72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5461 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  100 
 
 		 769 aa  1580    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  32.86 
 
 		 709 aa  355  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  32.87 
 
 		 736 aa  298  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0022  hypothetical protein  31.97 
 
 		 299 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  27.12 
 
 		 420 aa  117  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5462  hypothetical protein  33.61 
 
 		 335 aa  106  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.99145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3442  hypothetical protein  34.3 
 
 		 295 aa  104  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000827494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  26.53 
 
 		 464 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  25.46 
 
 		 440 aa  97.8  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2958  hypothetical protein  33.53 
 
 		 269 aa  92.4  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1783  hypothetical protein  26.82 
 
 		 447 aa  91.7  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  27.67 
 
 		 464 aa  90.9  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6341  hypothetical protein  30.19 
 
 		 245 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  31.22 
 
 		 427 aa  90.1  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  25.61 
 
 		 445 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1782  hypothetical protein  33.52 
 
 		 253 aa  88.2  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  41.58 
 
 		 439 aa  87.8  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0856  hypothetical protein  42.02 
 
 		 270 aa  87.8  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0182389  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  42 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  40.44 
 
 		 577 aa  84.3  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  38.53 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  43.68 
 
 		 403 aa  84  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  43.88 
 
 		 478 aa  83.2  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  27.08 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  40.18 
 
 		 203 aa  82.4  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  25.96 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4983  hypothetical protein  29.61 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  41.38 
 
 		 406 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  33.33 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  38.1 
 
 		 454 aa  79.7  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  44.71 
 
 		 452 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  38.32 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  31.93 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3597  hypothetical protein  28.51 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  23.01 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5504  hypothetical protein  36.25 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241088  decreased coverage  0.000273581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  38.83 
 
 		 449 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  25.84 
 
 		 422 aa  72  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  33.59 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  31.76 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  41.86 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  39.53 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  34.4 
 
 		 415 aa  67  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  36.54 
 
 		 408 aa  67  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  30.58 
 
 		 533 aa  64.7  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  23.17 
 
 		 418 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0929  hypothetical protein  28.73 
 
 		 313 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0953225  normal  0.150817 
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  37.04 
 
 		 445 aa  63.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  37.65 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  50.98 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  35.43 
 
 		 610 aa  59.3  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0121  hypothetical protein  27.49 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.230908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  22.22 
 
 		 976 aa  54.3  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  24.79 
 
 		 369 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  29.59 
 
 		 608 aa  51.6  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  27.7 
 
 		 530 aa  52  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.29 
 
 		 429 aa  51.6  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  32.98 
 
 		 368 aa  47.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  44.9 
 
 		 452 aa  47  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  27.52 
 
 		 556 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  30.88 
 
 		 670 aa  45.4  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  29.25 
 
 		 399 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  29.47 
 
 		 562 aa  45.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  43.14 
 
 		 458 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  38.81 
 
 		 1125 aa  44.7  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  36.71 
 
 		 368 aa  44.3  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  24 
 
 		 448 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  30.88 
 
 		 891 aa  44.3  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  29.31 
 
 		 423 aa  44.3  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  24.21 
 
 		 448 aa  44.3  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4596  hypothetical protein  26.85 
 
 		 879 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0852353  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  44.19 
 
 		 596 aa  43.9  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>