87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2697 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  100 
 
 
410 aa  837    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  31.34 
 
 
439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  32.74 
 
 
437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  30.93 
 
 
427 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  32.99 
 
 
430 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  31.46 
 
 
423 aa  176  6e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  33.85 
 
 
422 aa  176  7e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  31.14 
 
 
452 aa  169  9e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  29.87 
 
 
455 aa  156  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  29.76 
 
 
482 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  31 
 
 
403 aa  146  8.000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  29.71 
 
 
449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  28.51 
 
 
478 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  29.91 
 
 
406 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  43.95 
 
 
203 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  26.44 
 
 
421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  27.27 
 
 
442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  38.76 
 
 
440 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  35.58 
 
 
422 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  27.93 
 
 
454 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  40.34 
 
 
408 aa  93.2  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  27.12 
 
 
445 aa  90.5  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  50 
 
 
410 aa  87  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  42.59 
 
 
464 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  43.16 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  25.96 
 
 
769 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  42.59 
 
 
360 aa  79  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  34.45 
 
 
736 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  25.36 
 
 
709 aa  77  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  47.13 
 
 
577 aa  76.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  38.68 
 
 
445 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  37.5 
 
 
464 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  34.46 
 
 
453 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  24.26 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  21.08 
 
 
353 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  30.53 
 
 
532 aa  63.5  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  33.33 
 
 
414 aa  63.2  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  36.27 
 
 
352 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  36.96 
 
 
415 aa  60.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  30.72 
 
 
610 aa  60.1  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  36.08 
 
 
369 aa  57.4  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  38.27 
 
 
608 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  34.15 
 
 
416 aa  52.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  52.38 
 
 
429 aa  52.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  31.4 
 
 
369 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  22.91 
 
 
336 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  31.78 
 
 
457 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  22.65 
 
 
424 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  33.33 
 
 
582 aa  50.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  37.5 
 
 
443 aa  49.7  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  31.37 
 
 
368 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4055  hypothetical protein  43.14 
 
 
494 aa  47.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.945685  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  29.59 
 
 
588 aa  47  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  36 
 
 
368 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  43.48 
 
 
176 aa  46.6  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  29.17 
 
 
285 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  27.7 
 
 
427 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  29.29 
 
 
458 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  35.96 
 
 
912 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  38.36 
 
 
708 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8073  ATPase-like protein  29.66 
 
 
362 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  23.64 
 
 
495 aa  46.2  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  36.73 
 
 
712 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  42.86 
 
 
650 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  43.14 
 
 
359 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  33.66 
 
 
515 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  36.46 
 
 
562 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  46.81 
 
 
591 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  27.84 
 
 
452 aa  44.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  24.86 
 
 
411 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  29.11 
 
 
976 aa  44.3  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  41.3 
 
 
362 aa  44.3  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  24.87 
 
 
353 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  39.34 
 
 
1303 aa  43.9  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  47.62 
 
 
596 aa  44.3  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  34.44 
 
 
431 aa  43.5  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  39.34 
 
 
1307 aa  43.9  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.78 
 
 
353 aa  43.5  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  30.21 
 
 
666 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  46.67 
 
 
708 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  32.99 
 
 
452 aa  43.5  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  27.03 
 
 
394 aa  43.5  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  33.9 
 
 
423 aa  43.5  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  49.02 
 
 
387 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.36 
 
 
607 aa  43.1  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  29.52 
 
 
514 aa  43.1  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09773  putative DNA replication and repair protein  34.62 
 
 
359 aa  42.7  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.753312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>