40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2531 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  100 
 
 		 608 aa  1250    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  29.74 
 
 		 610 aa  279  8e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  23.94 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  30.53 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  45.95 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  31.62 
 
 		 440 aa  66.6  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  41.33 
 
 		 418 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  24.73 
 
 		 455 aa  62  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  36.84 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  34.52 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  35.53 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  31.25 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  35.87 
 
 		 203 aa  55.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  38.27 
 
 		 410 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  30.05 
 
 		 482 aa  55.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  31.25 
 
 		 452 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  38.75 
 
 		 577 aa  54.7  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  28.03 
 
 		 439 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  39.24 
 
 		 430 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  35.8 
 
 		 406 aa  53.5  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  27.59 
 
 		 422 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  30 
 
 		 709 aa  52.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  45.61 
 
 		 445 aa  52  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  29.01 
 
 		 421 aa  52  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  34.65 
 
 		 769 aa  50.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  32.53 
 
 		 369 aa  50.4  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  39.02 
 
 		 442 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  41.67 
 
 		 429 aa  50.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  43.48 
 
 		 445 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  31.17 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  29.76 
 
 		 736 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  40.91 
 
 		 410 aa  48.9  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  45.45 
 
 		 408 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  34.29 
 
 		 478 aa  48.5  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  28.99 
 
 		 420 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  21.09 
 
 		 360 aa  48.5  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  38.33 
 
 		 464 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  32.5 
 
 		 464 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  30.91 
 
 		 437 aa  45.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  31 
 
 		 403 aa  45.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>