80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3137 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  100 
 
 		 449 aa  920    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  58.82 
 
 		 455 aa  521  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  52.89 
 
 		 452 aa  487  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  50.21 
 
 		 482 aa  482  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  35.01 
 
 		 423 aa  245  9e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  34.87 
 
 		 430 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  34.8 
 
 		 422 aa  242  1e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  30.96 
 
 		 437 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  27.83 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  31.23 
 
 		 403 aa  154  4e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  29.71 
 
 		 410 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  28.32 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  41.46 
 
 		 203 aa  141  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  28.63 
 
 		 421 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  28.31 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  26.89 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  27.35 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  28.09 
 
 		 439 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  27.95 
 
 		 442 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  28.17 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  27.46 
 
 		 478 aa  103  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  25.85 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  25.05 
 
 		 445 aa  98.2  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  40.83 
 
 		 420 aa  93.6  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  33.17 
 
 		 464 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  41.57 
 
 		 577 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  32.35 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  38.05 
 
 		 453 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  33.85 
 
 		 736 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  38.83 
 
 		 769 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  34.48 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  40.43 
 
 		 709 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  35.09 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  33.01 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  36.63 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  23.56 
 
 		 369 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  30.46 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.83 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  40 
 
 		 619 aa  61.6  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1963  hypothetical protein  28.16 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3230  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  58.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0080421  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  26.49 
 
 		 532 aa  58.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  31.25 
 
 		 608 aa  57.4  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  30.48 
 
 		 369 aa  57  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1135  hypothetical protein  24.94 
 
 		 447 aa  57  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.879789  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  35.96 
 
 		 712 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  35.87 
 
 		 368 aa  55.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  28.93 
 
 		 588 aa  54.7  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  33.33 
 
 		 368 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  30.68 
 
 		 457 aa  53.5  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  20.63 
 
 		 461 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  30.09 
 
 		 601 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  37.84 
 
 		 610 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  27.19 
 
 		 450 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  26.4 
 
 		 582 aa  50.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  24.44 
 
 		 336 aa  50.4  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  33.33 
 
 		 352 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  26.21 
 
 		 176 aa  49.3  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  34.62 
 
 		 353 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  33.67 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  31.87 
 
 		 443 aa  48.5  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  23.48 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  29.03 
 
 		 708 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  22.7 
 
 		 666 aa  47  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  46.81 
 
 		 452 aa  46.6  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5923  hypothetical protein  25.98 
 
 		 461 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  42.37 
 
 		 548 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1018  hypothetical protein  33.72 
 
 		 606 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88989e-33 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0853  ATPase  28.28 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  26.67 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  24.04 
 
 		 670 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  35.94 
 
 		 263 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2166  AAA ATPase  27.12 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000280978  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  26.75 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  34.29 
 
 		 284 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4055  hypothetical protein  44.44 
 
 		 494 aa  43.9  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.945685  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  33.72 
 
 		 562 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  28.89 
 
 		 976 aa  43.5  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  26.79 
 
 		 228 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  30 
 
 		 452 aa  43.1  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>