47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_7060 on replicon NC_010374
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  900    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  32.05 
 
 		 464 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  31.9 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  25.61 
 
 		 769 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  25.63 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  29.55 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  42.72 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  26.24 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  36 
 
 		 406 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  38.68 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  23.65 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  38.38 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  28.93 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  37.11 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  34.91 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  35.71 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  34.48 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  33.63 
 
 		 736 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  33.93 
 
 		 455 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  36.7 
 
 		 453 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  35.42 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  34.59 
 
 		 203 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  35.19 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  38.95 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  60.78 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  56.36 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  27.73 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  30.57 
 
 		 478 aa  67  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  38.3 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  34.65 
 
 		 709 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  34.62 
 
 		 454 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  36.63 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  30.28 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  35.71 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  31.25 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  31.07 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  41.05 
 
 		 577 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  24.1 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  28.87 
 
 		 610 aa  54.3  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  30.61 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  43.48 
 
 		 608 aa  50.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  26.56 
 
 		 368 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.4 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  40 
 
 		 574 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  27.34 
 
 		 619 aa  44.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  32.29 
 
 		 562 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  25.26 
 
 		 666 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>