84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0120 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 429 aa  886    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  25.42 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  25.29 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  26.07 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  22.3 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  29.93 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  42.35 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  23.5 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  23.41 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  25.93 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  22.83 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  36.67 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  29.1 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  22.93 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  30.83 
 
 		 449 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  42.86 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  29.94 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  27.57 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  29.03 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  22.41 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  36.71 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  29.53 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  36.46 
 
 		 442 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  34.78 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  32.65 
 
 		 203 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  27.45 
 
 		 464 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  27.93 
 
 		 455 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  34.04 
 
 		 577 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  28.97 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  32.98 
 
 		 482 aa  54.7  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5923  hypothetical protein  31.06 
 
 		 461 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  27.98 
 
 		 532 aa  53.5  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  33.33 
 
 		 464 aa  53.5  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  45.1 
 
 		 453 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  30.11 
 
 		 709 aa  53.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  36.17 
 
 		 478 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  34.95 
 
 		 251 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  52.38 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  27.16 
 
 		 736 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  28.79 
 
 		 769 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  24.51 
 
 		 643 aa  50.4  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  29.69 
 
 		 584 aa  50.1  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  37.04 
 
 		 610 aa  50.1  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  34.31 
 
 		 540 aa  50.1  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  26.51 
 
 		 582 aa  49.7  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  41.67 
 
 		 608 aa  50.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  43.4 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  30.67 
 
 		 708 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  34.18 
 
 		 368 aa  48.5  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  32.29 
 
 		 457 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  23.35 
 
 		 976 aa  47.4  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  41.54 
 
 		 513 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  29.63 
 
 		 369 aa  47.4  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  22.03 
 
 		 424 aa  47  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  29.55 
 
 		 228 aa  47  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  32.14 
 
 		 623 aa  46.6  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  52.38 
 
 		 360 aa  46.6  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  32.71 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  31.33 
 
 		 352 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.55 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  30.12 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  43.33 
 
 		 516 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2439  ABC transporter related protein  39.22 
 
 		 228 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00305111  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1567  AAA ATPase  23.21 
 
 		 556 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  29.79 
 
 		 353 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.09 
 
 		 548 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  28.44 
 
 		 446 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0479  ABC transporter ATP-binding protein  27.33 
 
 		 336 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.990168 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  23.01 
 
 		 666 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  32.11 
 
 		 443 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  33.85 
 
 		 176 aa  44.3  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  30.3 
 
 		 619 aa  43.9  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  42.11 
 
 		 452 aa  44.3  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  35 
 
 		 562 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.6 
 
 		 652 aa  43.9  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  40.48 
 
 		 533 aa  43.9  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0568  DNA replication and repair protein RecF  33.33 
 
 		 340 aa  43.5  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  28.4 
 
 		 448 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  28.4 
 
 		 448 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1513  hypothetical protein  24.58 
 
 		 444 aa  43.5  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  28.57 
 
 		 441 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  21.11 
 
 		 378 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0298  DNA repair protein RecN  34.92 
 
 		 506 aa  43.1  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  50 
 
 		 250 aa  43.1  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>