52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4173 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  100 
 
 		 415 aa  835    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  38.46 
 
 		 414 aa  250  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  27.75 
 
 		 418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  39.06 
 
 		 439 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  25.13 
 
 		 422 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  33.54 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  40.19 
 
 		 482 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  32.35 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  35.2 
 
 		 452 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  30.53 
 
 		 608 aa  77.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  37.17 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  34.55 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  31.85 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  38.38 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  38.46 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  24.23 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  41.38 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  40.82 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  35.48 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  41.41 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  34.19 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  39.08 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  37.84 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  27.84 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  38.18 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  37.65 
 
 		 709 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  42.62 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  34.4 
 
 		 769 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  55.1 
 
 		 454 aa  67  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  33.94 
 
 		 577 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.82 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  37.08 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  22.39 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  36.99 
 
 		 610 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  30.33 
 
 		 736 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  31.54 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  28.67 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  36.96 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  46.55 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  34.78 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  36.54 
 
 		 623 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  43.75 
 
 		 368 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  37.08 
 
 		 452 aa  47.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  26.97 
 
 		 302 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  32 
 
 		 368 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  43.4 
 
 		 352 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1620  ABC transporter related  27.84 
 
 		 302 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.479618  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  22.67 
 
 		 976 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  43.4 
 
 		 353 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  27.84 
 
 		 302 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  33.77 
 
 		 571 aa  43.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  32.79 
 
 		 670 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>