79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6340 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  100 
 
 		 420 aa  862    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  38.96 
 
 		 464 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  27.04 
 
 		 769 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  26.65 
 
 		 709 aa  99.8  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  25.85 
 
 		 464 aa  99.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  27.98 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  26.19 
 
 		 406 aa  96.3  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  40.83 
 
 		 449 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  48.35 
 
 		 203 aa  92.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  41.51 
 
 		 455 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  50 
 
 		 452 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  28.95 
 
 		 440 aa  90.1  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  46.39 
 
 		 482 aa  90.1  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  36.76 
 
 		 430 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  44.79 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  39.84 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  25.07 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  41.13 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  43.16 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  36.75 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  24.08 
 
 		 736 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  28.43 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  24.35 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  46.25 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  23.24 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  25.08 
 
 		 577 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  23.65 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  28.57 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  34.29 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  28.8 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  34.15 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  41.41 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  60 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  32.74 
 
 		 454 aa  66.2  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  34.78 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  25.4 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.57 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  31.58 
 
 		 619 aa  60.5  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  28.18 
 
 		 369 aa  59.7  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  27.78 
 
 		 533 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  29.75 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  30.08 
 
 		 353 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  30.77 
 
 		 382 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  28.65 
 
 		 386 aa  52.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  22.34 
 
 		 976 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1783  hypothetical protein  25.58 
 
 		 447 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  31.13 
 
 		 610 aa  50.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  24.79 
 
 		 532 aa  50.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  36.05 
 
 		 591 aa  50.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  28.99 
 
 		 608 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  39.24 
 
 		 712 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.53 
 
 		 669 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  40.74 
 
 		 708 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  26.37 
 
 		 382 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  26.37 
 
 		 382 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.31 
 
 		 708 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  29.76 
 
 		 666 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  31.45 
 
 		 452 aa  47  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  24.88 
 
 		 556 aa  47  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 359 aa  47  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  34.07 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  22.06 
 
 		 650 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  31.48 
 
 		 623 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.69 
 
 		 652 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  37.29 
 
 		 582 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  31.43 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  35.21 
 
 		 574 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5923  hypothetical protein  26.22 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  30.86 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  25.97 
 
 		 851 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  25.12 
 
 		 606 aa  43.9  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  32.39 
 
 		 566 aa  43.9  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  37.21 
 
 		 496 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  27.38 
 
 		 378 aa  43.5  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  36.36 
 
 		 670 aa  43.5  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  30.93 
 
 		 584 aa  43.5  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  26.92 
 
 		 395 aa  43.1  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1135  hypothetical protein  30.84 
 
 		 447 aa  43.1  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.879789  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  46.15 
 
 		 368 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>