50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0855 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 556 aa  1135    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  42.88 
 
 		 533 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  32.21 
 
 		 530 aa  264  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2495  hypothetical protein  23.72 
 
 		 630 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  34.33 
 
 		 588 aa  74.7  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  34.26 
 
 		 506 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  32.62 
 
 		 601 aa  62  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  28.89 
 
 		 509 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4743  hypothetical protein  24.53 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311034 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  26.49 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 709 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  21.91 
 
 		 976 aa  58.9  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  29.29 
 
 		 455 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  33.33 
 
 		 736 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3031  hypothetical protein  45.28 
 
 		 70 aa  54.7  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  35.9 
 
 		 457 aa  53.5  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0391  hypothetical protein  25.98 
 
 		 571 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000199178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  27.03 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  28.46 
 
 		 540 aa  51.2  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  24.17 
 
 		 251 aa  50.4  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  29.55 
 
 		 540 aa  50.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  37.97 
 
 		 647 aa  50.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  33.8 
 
 		 619 aa  49.7  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  30.38 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  28.57 
 
 		 519 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  38.57 
 
 		 450 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1567  AAA ATPase  28.75 
 
 		 556 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  22.03 
 
 		 712 aa  47.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0155  AAA ATPase  40.82 
 
 		 544 aa  47.4  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.754147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  24.88 
 
 		 420 aa  47  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  26.05 
 
 		 430 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  31.74 
 
 		 247 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  27.52 
 
 		 769 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2204  ABC transporter related  32.53 
 
 		 537 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1204  hypothetical protein  26.81 
 
 		 567 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530833  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  51.11 
 
 		 626 aa  45.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  31.29 
 
 		 888 aa  45.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  28.57 
 
 		 336 aa  45.1  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  28.91 
 
 		 513 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  26.67 
 
 		 440 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  29.41 
 
 		 431 aa  44.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0003  DNA replication and repair protein RecF  43.75 
 
 		 363 aa  44.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0752559  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  27.35 
 
 		 516 aa  44.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  38.46 
 
 		 858 aa  44.3  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  51.11 
 
 		 626 aa  44.3  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0317  ABC transporter related  29.33 
 
 		 283 aa  43.9  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000872921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1670  ABC transporter related  32.53 
 
 		 537 aa  43.9  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  25.23 
 
 		 388 aa  43.9  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  27.78 
 
 		 666 aa  43.5  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2742  ABC transporter-related protein  33.73 
 
 		 563 aa  43.5  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>