56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1984 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  100 
 
 		 566 aa  1177    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  42.95 
 
 		 548 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1872  hypothetical protein  28.61 
 
 		 585 aa  118  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0932  hypothetical protein  27.68 
 
 		 638 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0681  hypothetical protein  29.73 
 
 		 619 aa  94.7  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  26.97 
 
 		 529 aa  80.9  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  24.35 
 
 		 666 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  23.27 
 
 		 584 aa  75.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.43 
 
 		 708 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05008  hypothetical protein  26.12 
 
 		 658 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.58 
 
 		 616 aa  64.3  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  30.77 
 
 		 574 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.31 
 
 		 608 aa  62.4  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.25 
 
 		 613 aa  61.2  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.62 
 
 		 652 aa  60.8  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  23.03 
 
 		 680 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 		 495 aa  54.7  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  19.95 
 
 		 583 aa  54.3  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  25.38 
 
 		 691 aa  53.5  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  26.71 
 
 		 497 aa  53.5  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  32.26 
 
 		 378 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  33.9 
 
 		 623 aa  52  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  22.07 
 
 		 580 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  30.19 
 
 		 428 aa  51.2  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.27 
 
 		 634 aa  50.4  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  26.38 
 
 		 581 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  29.25 
 
 		 429 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  27.46 
 
 		 564 aa  50.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  23.64 
 
 		 398 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  24.14 
 
 		 628 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.73 
 
 		 608 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  22.55 
 
 		 506 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  33.33 
 
 		 572 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  32.58 
 
 		 565 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.67 
 
 		 642 aa  47.4  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  27.78 
 
 		 762 aa  47  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  24.79 
 
 		 634 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1107  hypothetical protein  24.84 
 
 		 591 aa  47  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000952777  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  28.67 
 
 		 688 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  29.71 
 
 		 464 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  29.91 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  28.72 
 
 		 347 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  28.38 
 
 		 606 aa  45.8  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  25 
 
 		 520 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  29.1 
 
 		 593 aa  45.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  30.12 
 
 		 595 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  23.47 
 
 		 467 aa  45.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  31.3 
 
 		 457 aa  45.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4992  hypothetical protein  32.39 
 
 		 380 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0565  hypothetical protein  28.92 
 
 		 556 aa  44.7  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.67 
 
 		 615 aa  44.3  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  30.38 
 
 		 408 aa  44.3  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  32.93 
 
 		 586 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  26.34 
 
 		 607 aa  44.3  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  32.39 
 
 		 420 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  24.79 
 
 		 603 aa  43.5  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>