51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2959 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  100 
 
 		 533 aa  1090    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  42.88 
 
 		 556 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  33.27 
 
 		 530 aa  240  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2495  hypothetical protein  23.83 
 
 		 630 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  35.14 
 
 		 588 aa  81.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  32.39 
 
 		 601 aa  70.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  29.66 
 
 		 461 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  33.01 
 
 		 769 aa  63.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  29.75 
 
 		 509 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  27.78 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  31.2 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  32.63 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  26.13 
 
 		 709 aa  58.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  32.56 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  24.07 
 
 		 976 aa  58.2  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4743  hypothetical protein  19.37 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  30.61 
 
 		 736 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  27.03 
 
 		 540 aa  53.9  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  31.58 
 
 		 457 aa  53.5  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0391  hypothetical protein  24.79 
 
 		 571 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000199178 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  27.97 
 
 		 540 aa  50.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  25.31 
 
 		 464 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3031  hypothetical protein  43.4 
 
 		 70 aa  49.7  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1567  AAA ATPase  28 
 
 		 556 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3405  ATP-binding protein  32 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00177365  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  26.39 
 
 		 532 aa  48.5  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  28.21 
 
 		 176 aa  48.5  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  33.33 
 
 		 440 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1513  hypothetical protein  22.42 
 
 		 444 aa  48.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  32 
 
 		 336 aa  47.8  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  37.35 
 
 		 450 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  34.15 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  29.09 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  25.71 
 
 		 495 aa  46.6  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1783  hypothetical protein  29.09 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  26.55 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1645  ATPase  29.81 
 
 		 451 aa  47  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  28.57 
 
 		 519 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  36.36 
 
 		 451 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  27.1 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  38.03 
 
 		 448 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4456  hypothetical protein  32.26 
 
 		 616 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.756747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  31.06 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  28.26 
 
 		 440 aa  44.7  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  28.72 
 
 		 619 aa  44.3  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0155  AAA ATPase  38 
 
 		 544 aa  44.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.754147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  26.71 
 
 		 431 aa  44.3  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  29.85 
 
 		 437 aa  43.9  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  50 
 
 		 427 aa  43.5  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  28.81 
 
 		 453 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  28.57 
 
 		 427 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>