63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3668 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  828    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  42.2 
 
 		 421 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  41.61 
 
 		 422 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  29.51 
 
 		 440 aa  179  7e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  28.12 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  28.2 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  29.15 
 
 		 442 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  27.06 
 
 		 430 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  27.75 
 
 		 445 aa  133  5e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  29.41 
 
 		 439 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  38.73 
 
 		 482 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  26.57 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  27.46 
 
 		 452 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  38.86 
 
 		 449 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  33.05 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  34.07 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  29.55 
 
 		 406 aa  113  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  37.21 
 
 		 437 aa  110  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  40.82 
 
 		 203 aa  107  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  27.73 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  32.98 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  40.34 
 
 		 410 aa  93.2  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  33.33 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  35.03 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  31.37 
 
 		 464 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  34.81 
 
 		 577 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  34.15 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  34.86 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  22.46 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  37.63 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  31.15 
 
 		 736 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  36.54 
 
 		 769 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  38.37 
 
 		 709 aa  67  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  35.71 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  22.39 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  44.23 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.94 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  33.91 
 
 		 532 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  36.84 
 
 		 610 aa  54.7  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  41.18 
 
 		 369 aa  50.8  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  27.23 
 
 		 368 aa  50.4  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  45.45 
 
 		 608 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  35 
 
 		 712 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  32.86 
 
 		 582 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  24.63 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  30.43 
 
 		 409 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0121  ATPase-like protein  31.9 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188452 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  28.45 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  38.6 
 
 		 452 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  24.21 
 
 		 588 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  27.68 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4110  ATPase-like protein  35.71 
 
 		 427 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000135453 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  28.41 
 
 		 352 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  33.33 
 
 		 458 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  33.33 
 
 		 619 aa  43.9  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  31.82 
 
 		 353 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  28.09 
 
 		 976 aa  43.5  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  43.86 
 
 		 574 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  37.88 
 
 		 452 aa  43.5  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  30.21 
 
 		 593 aa  43.1  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  30.53 
 
 		 251 aa  43.1  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  26.98 
 
 		 601 aa  43.1  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  30.49 
 
 		 176 aa  43.1  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>