78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0224 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  100 
 
 		 352 aa  725    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  80.45 
 
 		 353 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  35.01 
 
 		 368 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  34.3 
 
 		 369 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  36.27 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  40 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  24.72 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  22.88 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  42.5 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  29.75 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  24.72 
 
 		 445 aa  55.1  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  34.09 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  23.18 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  34.62 
 
 		 455 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  32.53 
 
 		 403 aa  53.1  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  36.67 
 
 		 440 aa  52.8  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  47.83 
 
 		 453 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  26.34 
 
 		 418 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  32.82 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  37.11 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  36.08 
 
 		 423 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  37.65 
 
 		 203 aa  50.8  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  31.07 
 
 		 482 aa  51.2  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  32.04 
 
 		 437 aa  50.4  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  37.04 
 
 		 427 aa  50.4  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  35.29 
 
 		 414 aa  50.4  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  35.35 
 
 		 540 aa  50.4  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  42.59 
 
 		 464 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  31.37 
 
 		 442 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 495 aa  50.1  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  33.33 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4015  ABC transporter, ATP-binding protein-related protein  33.33 
 
 		 556 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  27.78 
 
 		 464 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  44.64 
 
 		 454 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  32.93 
 
 		 516 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  29.29 
 
 		 458 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  33.33 
 
 		 439 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  29.79 
 
 		 736 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  35 
 
 		 513 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  25.93 
 
 		 360 aa  47  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  40 
 
 		 377 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  36.07 
 
 		 336 aa  47  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0007  AAA ATPase  22.31 
 
 		 380 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  37.5 
 
 		 368 aa  46.6  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.33 
 
 		 429 aa  46.2  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  29.13 
 
 		 452 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  33.33 
 
 		 457 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  40.85 
 
 		 708 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3811  ABC transporter related  30.1 
 
 		 218 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4084  ABC transporter related  27.61 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185467  normal  0.229237 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3839  ABC polysaccharide export transporter, ATPase subunit  27.61 
 
 		 273 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00536302  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  31.87 
 
 		 532 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  23.04 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  43.4 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  37.63 
 
 		 478 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  40.74 
 
 		 548 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  30.97 
 
 		 1218 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001783  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  29.13 
 
 		 217 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  36.14 
 
 		 514 aa  44.3  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  23.45 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  28.16 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  28.41 
 
 		 408 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  28.16 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1538  hypothetical protein  43.4 
 
 		 476 aa  43.5  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  32.84 
 
 		 584 aa  43.9  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  47.92 
 
 		 1016 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  42 
 
 		 683 aa  43.5  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  34.57 
 
 		 769 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0003  recombination protein F  38 
 
 		 385 aa  43.1  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  32.47 
 
 		 387 aa  43.1  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  33.8 
 
 		 1190 aa  43.1  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  31.91 
 
 		 461 aa  43.1  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  35.29 
 
 		 427 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  35.21 
 
 		 467 aa  42.7  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  44.44 
 
 		 708 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  38.89 
 
 		 445 aa  42.7  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  34.55 
 
 		 666 aa  42.7  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  30.49 
 
 		 440 aa  42.7  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>