180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7563 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  100 
 
 
409 aa  812    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  27.96 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  29.52 
 
 
411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  26.01 
 
 
368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  28.3 
 
 
399 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  27.16 
 
 
382 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  27.16 
 
 
382 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  30.22 
 
 
424 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  28.88 
 
 
364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  29.43 
 
 
392 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  28.92 
 
 
365 aa  117  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  26.29 
 
 
367 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  26.29 
 
 
367 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  26.85 
 
 
378 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  27.15 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  24.52 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  25.72 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  26.01 
 
 
382 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  26.87 
 
 
394 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  27.45 
 
 
386 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  26.76 
 
 
369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  26.02 
 
 
430 aa  110  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  26.78 
 
 
362 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  27.6 
 
 
390 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  29.08 
 
 
392 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  29.43 
 
 
392 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  29.08 
 
 
392 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  29.08 
 
 
436 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  29.08 
 
 
436 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  29.08 
 
 
436 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  29.08 
 
 
436 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  26.92 
 
 
388 aa  106  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  28.46 
 
 
390 aa  106  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  28.68 
 
 
405 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  27.15 
 
 
390 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  28.18 
 
 
390 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  27.32 
 
 
390 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  27.32 
 
 
390 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  25.36 
 
 
397 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  27.58 
 
 
395 aa  104  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  28.57 
 
 
390 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  29.36 
 
 
390 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  27.17 
 
 
393 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  26.83 
 
 
390 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  25.86 
 
 
363 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  25.62 
 
 
363 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  25.06 
 
 
370 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  28.65 
 
 
390 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  28.65 
 
 
390 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  24.88 
 
 
369 aa  100  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  28.29 
 
 
398 aa  99.8  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  27.91 
 
 
388 aa  99.8  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  27.52 
 
 
397 aa  99  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  25.58 
 
 
385 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  29.81 
 
 
392 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  26.95 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  27.45 
 
 
390 aa  98.2  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  25.3 
 
 
370 aa  97.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  25.3 
 
 
370 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  28.65 
 
 
390 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  24.81 
 
 
376 aa  97.1  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  27.17 
 
 
410 aa  96.7  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  22.74 
 
 
364 aa  96.7  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  27.02 
 
 
398 aa  95.9  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  26.65 
 
 
385 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  26.78 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  25.12 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  26.5 
 
 
391 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  27.72 
 
 
387 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  26.03 
 
 
399 aa  94.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  25.3 
 
 
395 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  26.98 
 
 
391 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  26.65 
 
 
395 aa  94  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  24.83 
 
 
416 aa  94  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  27.52 
 
 
391 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  27.52 
 
 
391 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  27.52 
 
 
386 aa  94  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  27.58 
 
 
387 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  27.45 
 
 
391 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  24.94 
 
 
386 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  22.84 
 
 
395 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  27.49 
 
 
387 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  28.73 
 
 
388 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  22.84 
 
 
395 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  28.12 
 
 
388 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  27.95 
 
 
393 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  24.76 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  24.33 
 
 
416 aa  87.4  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  28.07 
 
 
454 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  27.98 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  25.59 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  23.24 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  22.73 
 
 
448 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  27.03 
 
 
362 aa  83.2  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  31.47 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  22.74 
 
 
409 aa  83.2  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  22.93 
 
 
448 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  25.25 
 
 
397 aa  82.8  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  26.22 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  27.2 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.086198 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>