129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3030 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 406 aa  835    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  61.94 
 
 		 403 aa  531  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  32.97 
 
 		 423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  31.2 
 
 		 422 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  31.59 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  32.11 
 
 		 454 aa  159  9e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  30.54 
 
 		 452 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  28.86 
 
 		 455 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  32.06 
 
 		 410 aa  150  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  29.18 
 
 		 439 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  26.55 
 
 		 482 aa  142  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  27.83 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  30.55 
 
 		 442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  25.57 
 
 		 440 aa  137  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  29.91 
 
 		 410 aa  132  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  25.56 
 
 		 427 aa  126  7e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  30.06 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  28.2 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  29.1 
 
 		 421 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  29.55 
 
 		 408 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  44.68 
 
 		 203 aa  99.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  25.28 
 
 		 445 aa  97.4  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  28.53 
 
 		 464 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  26.19 
 
 		 420 aa  96.3  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  25.4 
 
 		 464 aa  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  46.24 
 
 		 478 aa  89.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  26.07 
 
 		 577 aa  83.2  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.42 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  41.38 
 
 		 769 aa  80.5  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  37.17 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  36 
 
 		 445 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  39.29 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  43.42 
 
 		 709 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  27.27 
 
 		 736 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  31.82 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  44.12 
 
 		 453 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  32.61 
 
 		 496 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  32.95 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  25.72 
 
 		 353 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  24.84 
 
 		 429 aa  56.2  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0003  DNA replication and repair protein RecF  58.7 
 
 		 370 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  29.25 
 
 		 369 aa  54.3  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0883  hypothetical protein  35.23 
 
 		 79 aa  53.9  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  35.8 
 
 		 608 aa  53.5  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  32.82 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3230  hypothetical protein  45 
 
 		 113 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0080421  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0989  hypothetical protein  26.67 
 
 		 433 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.613523  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  34.85 
 
 		 1063 aa  50.1  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.109982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1277 aa  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  25 
 
 		 532 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32662  predicted protein  32.93 
 
 		 1060 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.429677 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3146  DNA replication and repair protein RecF  46.51 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.522741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0003  recombination protein F  53.49 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671854  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.73 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54192  predicted protein  43.48 
 
 		 1099 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  29.93 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  30 
 
 		 582 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.74 
 
 		 369 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0005  DNA replication and repair protein RecF  50 
 
 		 412 aa  47.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0464034  hitchhiker  1.0596299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  47.06 
 
 		 789 aa  47.4  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  24.73 
 
 		 372 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0045  recombination protein F  46.51 
 
 		 372 aa  47  0.0006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.498392  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  40.74 
 
 		 423 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  43.4 
 
 		 381 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  31.58 
 
 		 369 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  27.91 
 
 		 441 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  36.67 
 
 		 452 aa  46.6  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30460  structural maintenance of chromosomes protein  30.23 
 
 		 1093 aa  46.6  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.157057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0003  recombination protein F  43.1 
 
 		 360 aa  46.6  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0188151  hitchhiker  0.0000523089 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08742  structural maintenance of chromosome complex subunit SmcA (AFU_orthologue; AFUA_6G02700)  39.68 
 
 		 1185 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183997  normal  0.16607 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0076  recombination protein F  46.51 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0015  recombination protein F  43.1 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00214178  hitchhiker  0.000779425 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  28.57 
 
 		 610 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.69 
 
 		 647 aa  46.2  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  27.08 
 
 		 697 aa  46.2  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3501  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  30.49 
 
 		 582 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  40.68 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  30.43 
 
 		 712 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  34.94 
 
 		 359 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  48.84 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  33.33 
 
 		 606 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1052  DNA repair protein RecN  47.92 
 
 		 565 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64147  Structural maintenance of chromosome protein 1 (sister chromatid cohesion complex Cohesin, subunit SMC1)  47.27 
 
 		 1240 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  28.45 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0003  recombination protein F  43.1 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  24.83 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0003  DNA replication and repair protein RecF  42.22 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  0.393317 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  23.51 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  37.25 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  48.84 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  42.55 
 
 		 888 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  44.19 
 
 		 377 aa  44.3  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30705  predicted protein  38.1 
 
 		 1225 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0008  recombination protein F  43.1 
 
 		 360 aa  44.3  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0621721  hitchhiker  0.00000000274736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0534  DNA replication and repair protein RecF  46.51 
 
 		 367 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921957  hitchhiker  0.00000000241058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2713  hypothetical protein  21.93 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0498  hypothetical protein  44.19 
 
 		 370 aa  44.3  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  41.86 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2800  recombination protein F  44.44 
 
 		 356 aa  43.9  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  29.67 
 
 		 431 aa  43.9  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>