54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2599 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  100 
 
 
619 aa  1210    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  32.05 
 
 
712 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  31.02 
 
 
562 aa  93.6  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1018  hypothetical protein  28.89 
 
 
606 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88989e-33 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  26.85 
 
 
582 aa  79.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  41.18 
 
 
452 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  39.78 
 
 
455 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  40.66 
 
 
482 aa  62.8  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  36.27 
 
 
430 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  40 
 
 
449 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  31.58 
 
 
420 aa  60.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  32.84 
 
 
437 aa  60.5  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  37.93 
 
 
251 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  40.32 
 
 
457 aa  57.8  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.51 
 
 
652 aa  56.6  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  35.96 
 
 
464 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  38.6 
 
 
452 aa  53.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  35.14 
 
 
532 aa  51.6  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  36.51 
 
 
423 aa  50.8  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  33.71 
 
 
454 aa  50.8  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  38.1 
 
 
422 aa  50.8  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  29.75 
 
 
506 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  45.28 
 
 
176 aa  50.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  33.8 
 
 
556 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  27.82 
 
 
976 aa  49.3  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  37.31 
 
 
695 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  25.31 
 
 
530 aa  48.5  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  34.02 
 
 
440 aa  48.1  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  32.77 
 
 
643 aa  48.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  39.47 
 
 
439 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  40 
 
 
601 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  34.85 
 
 
519 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  24.79 
 
 
461 aa  47  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  28.45 
 
 
540 aa  47.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  36.05 
 
 
203 aa  46.2  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  29.9 
 
 
515 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1204  hypothetical protein  31.19 
 
 
567 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530833  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  33.67 
 
 
478 aa  45.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  33.33 
 
 
336 aa  45.4  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  30.61 
 
 
484 aa  45.8  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  24.56 
 
 
455 aa  45.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  42.86 
 
 
423 aa  45.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  35 
 
 
616 aa  45.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  27.34 
 
 
445 aa  44.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  37.04 
 
 
452 aa  44.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  31.82 
 
 
610 aa  44.3  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  28.72 
 
 
533 aa  44.3  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  32.97 
 
 
896 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  25 
 
 
509 aa  44.3  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  29.03 
 
 
406 aa  43.9  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  40.74 
 
 
228 aa  43.9  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.3 
 
 
429 aa  43.9  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  33.33 
 
 
408 aa  43.9  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  31.75 
 
 
666 aa  43.9  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>