47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1424 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  100 
 
 
712 aa  1462    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  32.05 
 
 
619 aa  105  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1018  hypothetical protein  36.1 
 
 
606 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88989e-33 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  30.84 
 
 
582 aa  95.5  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  32.45 
 
 
562 aa  89  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  35.96 
 
 
449 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  34.41 
 
 
482 aa  55.1  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  34.74 
 
 
452 aa  55.1  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  39.74 
 
 
464 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  47.27 
 
 
455 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  35.29 
 
 
440 aa  54.3  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  36.59 
 
 
203 aa  53.9  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  35.29 
 
 
454 aa  52.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  34.78 
 
 
442 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  27.11 
 
 
709 aa  51.6  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  26.8 
 
 
452 aa  51.6  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  29.9 
 
 
437 aa  51.2  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  26.24 
 
 
423 aa  51.2  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  27.03 
 
 
422 aa  50.8  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  38.36 
 
 
439 aa  50.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  28.87 
 
 
532 aa  50.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  38.16 
 
 
430 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  42.86 
 
 
457 aa  50.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  39.24 
 
 
420 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  31.07 
 
 
403 aa  48.9  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  31.63 
 
 
515 aa  48.5  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  35 
 
 
408 aa  47.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0896  hypothetical protein  25.3 
 
 
672 aa  47.8  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.693496  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  31.51 
 
 
176 aa  47.4  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  30.66 
 
 
643 aa  47.8  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0391  hypothetical protein  26.79 
 
 
571 aa  47.8  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000199178 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  22.03 
 
 
556 aa  47.4  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  35.35 
 
 
577 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  36.51 
 
 
251 aa  47  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  32.81 
 
 
695 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  36.07 
 
 
427 aa  47  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  30.43 
 
 
406 aa  46.2  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  32.53 
 
 
228 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  36.73 
 
 
410 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  30.56 
 
 
252 aa  46.6  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1567  AAA ATPase  25.93 
 
 
556 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  34.41 
 
 
623 aa  44.7  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  25.17 
 
 
496 aa  45.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  23.66 
 
 
736 aa  45.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  28.38 
 
 
421 aa  44.3  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  22.77 
 
 
509 aa  43.9  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  34.33 
 
 
453 aa  43.9  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>