198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2512 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  784    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  65.17 
 
 		 377 aa  532  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  52.88 
 
 		 368 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  47.3 
 
 		 378 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  45.36 
 
 		 370 aa  318  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  42.29 
 
 		 370 aa  290  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  42.02 
 
 		 370 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  39.04 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  39.89 
 
 		 369 aa  270  4e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  39.36 
 
 		 363 aa  268  8.999999999999999e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  38.44 
 
 		 363 aa  266  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  39.84 
 
 		 357 aa  266  5.999999999999999e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  39.74 
 
 		 367 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  39.74 
 
 		 367 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  38.34 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  39.79 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  37.27 
 
 		 365 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  35.66 
 
 		 416 aa  243  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  37.5 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  35.79 
 
 		 364 aa  232  8.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  34.32 
 
 		 376 aa  219  5e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  34.83 
 
 		 369 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  35.06 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  35.16 
 
 		 370 aa  202  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  30.63 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  25.51 
 
 		 382 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  25.51 
 
 		 382 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  27.89 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  25.69 
 
 		 382 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  29.17 
 
 		 397 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  27.81 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  26.37 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  27.75 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  27.75 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  28.88 
 
 		 388 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  26.46 
 
 		 392 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  27.91 
 
 		 388 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  25.32 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  25.13 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  24.69 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  25.65 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  25.19 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  27.75 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  26.84 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  24.28 
 
 		 409 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  24.02 
 
 		 390 aa  102  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  24.18 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  27.22 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  23.59 
 
 		 390 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  25.37 
 
 		 436 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  25.37 
 
 		 392 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  25.37 
 
 		 436 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  25.37 
 
 		 436 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  25.37 
 
 		 392 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  25.37 
 
 		 436 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  22.72 
 
 		 390 aa  99.8  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  23.85 
 
 		 390 aa  99.4  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  25.13 
 
 		 390 aa  99.4  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  25.41 
 
 		 365 aa  99.4  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  24.18 
 
 		 390 aa  99.8  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  25.37 
 
 		 392 aa  99.4  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  24.26 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  34.78 
 
 		 394 aa  97.4  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  24.37 
 
 		 393 aa  96.7  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  23.76 
 
 		 386 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  25.13 
 
 		 385 aa  96.3  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  24.18 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  23.59 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  24.32 
 
 		 399 aa  95.1  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  24.79 
 
 		 386 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  24.1 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  29.5 
 
 		 226 aa  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  25.54 
 
 		 395 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  25.28 
 
 		 367 aa  90.9  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  27.25 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  23.3 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  23.3 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  24.13 
 
 		 399 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  25.81 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  31.69 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  23.4 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  23.7 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  25.34 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  23.59 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  25.91 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  44.32 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  22.28 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  23.27 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  27.27 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  26.55 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  23.51 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  22.86 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  22.25 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  24.4 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  21.71 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  36.19 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  21.92 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  22.34 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  23.69 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  21.92 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>