74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4982 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  950    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  38.96 
 
 
420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  29.43 
 
 
430 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  28.53 
 
 
406 aa  96.7  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  42.31 
 
 
403 aa  94.4  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  33.17 
 
 
449 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  44.57 
 
 
455 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  27.55 
 
 
769 aa  90.9  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  25.89 
 
 
464 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  37.14 
 
 
423 aa  89  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  35.71 
 
 
478 aa  88.6  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  35.42 
 
 
422 aa  89  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  45.65 
 
 
203 aa  88.2  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  35.25 
 
 
452 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  33.99 
 
 
482 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  42.59 
 
 
410 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  26.04 
 
 
577 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  43.18 
 
 
439 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  32.93 
 
 
442 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  35.03 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  32.16 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  34.81 
 
 
422 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  31.02 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  27.37 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  37.86 
 
 
454 aa  75.5  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  24.94 
 
 
709 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  31.65 
 
 
440 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  35.04 
 
 
427 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  31.68 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  35.77 
 
 
453 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  35.71 
 
 
445 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  40.82 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  39.13 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  31.4 
 
 
736 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  45.45 
 
 
445 aa  70.1  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  27.32 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  25.2 
 
 
418 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1783  hypothetical protein  31.13 
 
 
447 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  29.59 
 
 
452 aa  56.2  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.33 
 
 
429 aa  55.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  39.74 
 
 
712 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  35.96 
 
 
619 aa  53.9  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  25.96 
 
 
582 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  25.78 
 
 
532 aa  50.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  25.31 
 
 
533 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  44.44 
 
 
353 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  42.59 
 
 
352 aa  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  27.07 
 
 
378 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  35.14 
 
 
708 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  31.91 
 
 
976 aa  48.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  35.8 
 
 
591 aa  47.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  31.94 
 
 
562 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  29.71 
 
 
566 aa  47  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  35.8 
 
 
610 aa  47  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  34.72 
 
 
574 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  39.66 
 
 
670 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  27.35 
 
 
666 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  39.62 
 
 
458 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  37.5 
 
 
368 aa  45.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  24.26 
 
 
369 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  32.5 
 
 
608 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5288  SMC domain protein  26.51 
 
 
610 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  30.95 
 
 
359 aa  45.1  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  39.53 
 
 
496 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  29.63 
 
 
623 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  24.48 
 
 
530 aa  45.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  35.71 
 
 
452 aa  44.3  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  21.15 
 
 
442 aa  44.3  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.17 
 
 
652 aa  43.9  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  30 
 
 
780 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  27.21 
 
 
457 aa  43.1  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1280  ABC transporter related  27.72 
 
 
279 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161997  normal  0.0814876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  35 
 
 
409 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.22 
 
 
351 aa  43.1  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>