89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2264 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  918    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  28.32 
 
 		 461 aa  137  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  35.12 
 
 		 176 aa  116  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  22.87 
 
 		 532 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  26.34 
 
 		 452 aa  79.7  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  26.7 
 
 		 228 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  25.15 
 
 		 251 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  62  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  24.26 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  25.18 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  40.32 
 
 		 619 aa  57.4  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  32.53 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  28.79 
 
 		 482 aa  55.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  27.92 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  35.21 
 
 		 976 aa  55.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  36.62 
 
 		 450 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  31.87 
 
 		 284 aa  55.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  31.13 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1645  ATPase  37.68 
 
 		 451 aa  53.9  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  35.9 
 
 		 556 aa  53.5  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  35.21 
 
 		 446 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  34.04 
 
 		 484 aa  53.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  30.68 
 
 		 449 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  31.58 
 
 		 533 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  32.58 
 
 		 540 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  44.64 
 
 		 642 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  25.34 
 
 		 601 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  34.88 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  30 
 
 		 427 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  30.85 
 
 		 582 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  31.78 
 
 		 410 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  27.54 
 
 		 285 aa  50.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  36.62 
 
 		 448 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  27.01 
 
 		 439 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  35.21 
 
 		 457 aa  50.1  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  36.51 
 
 		 451 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  42.86 
 
 		 712 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  33.33 
 
 		 513 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  34.48 
 
 		 680 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  41.38 
 
 		 562 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  32.1 
 
 		 516 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  27.33 
 
 		 368 aa  48.5  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  30.93 
 
 		 540 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  31.51 
 
 		 530 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  28.72 
 
 		 588 aa  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  27.35 
 
 		 431 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  35.82 
 
 		 448 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  34.92 
 
 		 442 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  31.96 
 
 		 586 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  35.82 
 
 		 448 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.29 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0007  AAA ATPase  29.11 
 
 		 380 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0853  ATPase  35.82 
 
 		 445 aa  47  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  36.99 
 
 		 443 aa  47  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3405  ATP-binding protein  32.22 
 
 		 454 aa  47  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00177365  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  33.8 
 
 		 423 aa  47  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4877  AAA ATPase  21.45 
 
 		 591 aa  47  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0546065  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  27.55 
 
 		 276 aa  46.6  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2370  AAA ATPase  25.48 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  33.33 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  30.4 
 
 		 440 aa  45.8  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  26.8 
 
 		 567 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  39.24 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  30.61 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  29.57 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  37.97 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  44 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  26.44 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0681  hypothetical protein  33.04 
 
 		 619 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4743  hypothetical protein  30.43 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311034 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1018  hypothetical protein  27.08 
 
 		 606 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88989e-33 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  31.58 
 
 		 403 aa  45.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  32.08 
 
 		 359 aa  44.3  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  33.33 
 
 		 408 aa  44.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0454  AAA ATPase  23.42 
 
 		 606 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  34.92 
 
 		 454 aa  44.3  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  22.65 
 
 		 506 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  35.14 
 
 		 441 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  35.09 
 
 		 453 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  24.84 
 
 		 519 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  37.84 
 
 		 429 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  34.25 
 
 		 769 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  40 
 
 		 478 aa  43.5  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  32.23 
 
 		 598 aa  43.5  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.33 
 
 		 548 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2495  hypothetical protein  29.29 
 
 		 630 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  36.21 
 
 		 427 aa  43.1  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  35.63 
 
 		 382 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  27.21 
 
 		 464 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>