51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1584 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  100 
 
 		 540 aa  1090    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  38.3 
 
 		 513 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  37.74 
 
 		 516 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1567  AAA ATPase  26.59 
 
 		 556 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  27.97 
 
 		 484 aa  140  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331613 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10058  ea59  31.46 
 
 		 312 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.107318  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00755  hypothetical protein  31.46 
 
 		 290 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.137784  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05619  hypothetical protein  33.06 
 
 		 254 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1204  hypothetical protein  33.79 
 
 		 567 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530833  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  27.16 
 
 		 540 aa  77.4  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  23.77 
 
 		 567 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  31.19 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  25.93 
 
 		 533 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  24.08 
 
 		 418 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  32.58 
 
 		 457 aa  53.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  25.58 
 
 		 556 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  23.7 
 
 		 588 aa  53.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.57 
 
 		 669 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  31.47 
 
 		 251 aa  51.6  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  35.35 
 
 		 352 aa  50.4  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  36.36 
 
 		 353 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.31 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  34.71 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  35.05 
 
 		 448 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  31.03 
 
 		 643 aa  48.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  29.93 
 
 		 532 aa  48.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1441  hypothetical protein  31.51 
 
 		 307 aa  48.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0532167  hitchhiker  0.00000885873 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  29.63 
 
 		 519 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  31.17 
 
 		 586 aa  47.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  25.88 
 
 		 461 aa  47.4  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.99 
 
 		 639 aa  47.4  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  28.57 
 
 		 509 aa  47.4  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  28.45 
 
 		 619 aa  47  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  42.25 
 
 		 423 aa  47  0.0009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  39.71 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  26 
 
 		 601 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  27.37 
 
 		 736 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  45.1 
 
 		 773 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  31.25 
 
 		 623 aa  44.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  40.58 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  33.33 
 
 		 448 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  31.82 
 
 		 228 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  34 
 
 		 236 aa  44.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.52 
 
 		 307 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0943  hypothetical protein  36.49 
 
 		 565 aa  44.3  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000190881  hitchhiker  0.00360431 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  36.23 
 
 		 441 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  33.33 
 
 		 457 aa  43.9  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  34.21 
 
 		 455 aa  43.9  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  28.24 
 
 		 584 aa  43.5  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  28.3 
 
 		 453 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  30.61 
 
 		 414 aa  43.5  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>