55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4238 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  100 
 
 		 588 aa  1219    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  56.76 
 
 		 601 aa  609  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  35.14 
 
 		 533 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  34.35 
 
 		 530 aa  77  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  28.99 
 
 		 509 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  34.33 
 
 		 556 aa  74.7  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  30.95 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  28.57 
 
 		 519 aa  68.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0391  hypothetical protein  23.42 
 
 		 571 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000199178 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  25.95 
 
 		 976 aa  63.9  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  28.47 
 
 		 506 aa  63.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  30.43 
 
 		 540 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  29.17 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  24.86 
 
 		 562 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  30.6 
 
 		 582 aa  58.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  31.73 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  28.93 
 
 		 449 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  26.67 
 
 		 430 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  30.28 
 
 		 455 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  23.7 
 
 		 540 aa  53.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  20.56 
 
 		 251 aa  52.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  29.89 
 
 		 437 aa  52.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  24.74 
 
 		 452 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  28.81 
 
 		 567 aa  50.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1567  AAA ATPase  24.14 
 
 		 556 aa  50.4  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  25.95 
 
 		 452 aa  50.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  26.83 
 
 		 399 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  28.72 
 
 		 457 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  23.5 
 
 		 427 aa  47.4  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  27.43 
 
 		 228 aa  47.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.88 
 
 		 677 aa  47  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.88 
 
 		 677 aa  47  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  29.59 
 
 		 410 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  21.88 
 
 		 484 aa  47  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4743  hypothetical protein  23.16 
 
 		 478 aa  47  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  24 
 
 		 439 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  25.53 
 
 		 532 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  23.68 
 
 		 176 aa  46.2  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  28.57 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2495  hypothetical protein  23.45 
 
 		 630 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  24.21 
 
 		 408 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  21.31 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  25 
 
 		 422 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  33.71 
 
 		 443 aa  44.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  23.53 
 
 		 513 aa  44.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  22.04 
 
 		 421 aa  44.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  30.3 
 
 		 736 aa  44.3  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  26.32 
 
 		 448 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  24.59 
 
 		 516 aa  44.3  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1347  Type I secretion system ATPase, PrtD  31.3 
 
 		 568 aa  43.9  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.753541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  26.32 
 
 		 448 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  34.25 
 
 		 448 aa  44.3  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  25.97 
 
 		 779 aa  43.9  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  32.88 
 
 		 450 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  31.68 
 
 		 718 aa  43.5  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>