27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1567 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1567  AAA ATPase  100 
 
 		 556 aa  1129    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  29.6 
 
 		 484 aa  206  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  25.96 
 
 		 540 aa  170  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  25.05 
 
 		 513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  24.35 
 
 		 516 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00755  hypothetical protein  28.96 
 
 		 290 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.137784  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10058  ea59  28.96 
 
 		 312 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.107318  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1204  hypothetical protein  22.11 
 
 		 567 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530833  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  23.05 
 
 		 567 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05619  hypothetical protein  26.19 
 
 		 254 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  32.17 
 
 		 540 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  24.14 
 
 		 588 aa  50.4  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  24.85 
 
 		 228 aa  50.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  28 
 
 		 533 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  38.24 
 
 		 251 aa  48.9  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  27.03 
 
 		 495 aa  48.5  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  26.38 
 
 		 509 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  28.75 
 
 		 556 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  27.14 
 
 		 449 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  24.09 
 
 		 601 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  34.25 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.35 
 
 		 615 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  25.93 
 
 		 712 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  32.1 
 
 		 431 aa  44.3  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  31.9 
 
 		 680 aa  43.9  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.1 
 
 		 573 aa  43.9  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  23.91 
 
 		 506 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>