26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1204 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1204  hypothetical protein  100 
 
 		 567 aa  1165    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530833  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  26.95 
 
 		 567 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  23.95 
 
 		 513 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  24.31 
 
 		 484 aa  104  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  27.15 
 
 		 540 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1567  AAA ATPase  22.11 
 
 		 556 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  33.79 
 
 		 540 aa  83.2  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  34.44 
 
 		 516 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  37.23 
 
 		 509 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013183 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10058  ea59  26.24 
 
 		 312 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.107318  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00755  hypothetical protein  26.24 
 
 		 290 aa  50.4  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.137784  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  30.58 
 
 		 461 aa  50.4  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  31.25 
 
 		 597 aa  50.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  34.09 
 
 		 623 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05619  hypothetical protein  22.56 
 
 		 254 aa  48.5  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  34.67 
 
 		 688 aa  47.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  28.68 
 
 		 532 aa  47  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  32.22 
 
 		 519 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  35.35 
 
 		 595 aa  46.6  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  24.93 
 
 		 440 aa  47  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  26.81 
 
 		 556 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0391  hypothetical protein  26.19 
 
 		 571 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000199178 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  31.19 
 
 		 619 aa  45.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  38.89 
 
 		 446 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  35.06 
 
 		 593 aa  43.9  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  31.48 
 
 		 234 aa  43.9  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>