49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1735 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  100 
 
 
484 aa  997    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1567  AAA ATPase  29.6 
 
 
556 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  29.58 
 
 
516 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  28.95 
 
 
513 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  27.75 
 
 
540 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1204  hypothetical protein  24.31 
 
 
567 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530833  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00755  hypothetical protein  28.12 
 
 
290 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.137784  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10058  ea59  28.12 
 
 
312 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.107318  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05619  hypothetical protein  31.02 
 
 
254 aa  89  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  24.76 
 
 
540 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  35.45 
 
 
567 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 
416 aa  53.9  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  34.04 
 
 
457 aa  53.5  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  33.08 
 
 
370 aa  52  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  28.81 
 
 
461 aa  51.6  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  32.32 
 
 
377 aa  50.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  25.45 
 
 
455 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.89 
 
 
573 aa  49.7  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  28.7 
 
 
368 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  31.82 
 
 
506 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  29.21 
 
 
643 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2160  ABC transporter related  25.1 
 
 
374 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.091437  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  26.92 
 
 
310 aa  47.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  33.33 
 
 
532 aa  47.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  31.52 
 
 
509 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  21.88 
 
 
588 aa  47  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  36.11 
 
 
448 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  36.49 
 
 
437 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  33.71 
 
 
515 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3229  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  26.61 
 
 
369 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301475  normal  0.329257 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  30.61 
 
 
619 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  34.72 
 
 
457 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  29.91 
 
 
566 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  31.94 
 
 
450 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  23.53 
 
 
584 aa  44.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  32.47 
 
 
586 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  31.93 
 
 
446 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  47.83 
 
 
429 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  30.99 
 
 
519 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2971  ABC transporter related  25 
 
 
254 aa  44.3  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  23.44 
 
 
311 aa  44.3  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20330  cell division ATP-binding protein FtsE  25.58 
 
 
344 aa  43.9  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.599881  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.58 
 
 
566 aa  43.9  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  32.95 
 
 
176 aa  43.5  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  25.23 
 
 
227 aa  43.5  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  23.26 
 
 
368 aa  43.5  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5154  ABC transporter related  25.44 
 
 
238 aa  43.5  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.792432 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0843  ATPase  37.93 
 
 
602 aa  43.5  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000396112  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.93 
 
 
652 aa  43.1  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>