109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4944 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  100 
 
 		 540 aa  1097    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1204  hypothetical protein  27.15 
 
 		 567 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530833  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  23.93 
 
 		 567 aa  91.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  24.76 
 
 		 484 aa  86.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  23.32 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  26.17 
 
 		 540 aa  77.8  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  24.16 
 
 		 513 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  35.09 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1567  AAA ATPase  32.17 
 
 		 556 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  31.37 
 
 		 519 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  30.43 
 
 		 588 aa  63.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0391  hypothetical protein  32.08 
 
 		 571 aa  60.5  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000199178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  33.12 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  31.58 
 
 		 601 aa  57.4  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  37.5 
 
 		 532 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  32.24 
 
 		 976 aa  53.9  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  27.03 
 
 		 533 aa  53.9  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  32.56 
 
 		 461 aa  53.5  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  29.55 
 
 		 556 aa  50.4  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  32.11 
 
 		 254 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2116  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  28.19 
 
 		 553 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  32.91 
 
 		 246 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  23.85 
 
 		 284 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.74 
 
 		 592 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  26.9 
 
 		 530 aa  48.5  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2376  ABC transporter related  31.54 
 
 		 249 aa  48.5  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2976  ABC transporter related  23.72 
 
 		 562 aa  48.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  25.93 
 
 		 269 aa  47.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  26.43 
 
 		 255 aa  47.8  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1291  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  26.06 
 
 		 337 aa  47.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.276741  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.41 
 
 		 595 aa  47.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  31.43 
 
 		 457 aa  47.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  30.39 
 
 		 228 aa  47.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  24.84 
 
 		 284 aa  47.4  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1009  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  27.33 
 
 		 341 aa  47.4  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933664  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  31.07 
 
 		 272 aa  47.4  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  31.07 
 
 		 584 aa  47.4  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2276  ABC transporter related  32.73 
 
 		 249 aa  47  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1702  arginine transporter ATP-binding subunit  33.64 
 
 		 249 aa  47.4  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0357255  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1968  arginine transporter ATP-binding subunit  33.64 
 
 		 249 aa  47  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1061  polar amino acid ABC transporter ATPase  35.21 
 
 		 300 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.5 
 
 		 603 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3811  ABC transporter related  25.64 
 
 		 563 aa  46.6  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  31.71 
 
 		 244 aa  47  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2538  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  31.43 
 
 		 257 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2592  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  31.43 
 
 		 258 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2580  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  31.43 
 
 		 258 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.676694  normal  0.169811 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2492  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  31.43 
 
 		 258 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.793796  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2701  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  31.43 
 
 		 258 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  29.09 
 
 		 254 aa  46.6  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  35.21 
 
 		 246 aa  46.6  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_002620  TC0610  excinuclease ABC subunit A  28.71 
 
 		 1787 aa  45.8  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  35.21 
 
 		 273 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  27.97 
 
 		 388 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0599  ABC transporter related protein  34.18 
 
 		 243 aa  45.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3441  ABC transporter related  22.46 
 
 		 269 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0951  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  27.33 
 
 		 341 aa  46.2  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.31 
 
 		 639 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  38.89 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  24.03 
 
 		 549 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1445  ABC transporter related  31.43 
 
 		 249 aa  45.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.124868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  31.25 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  29.55 
 
 		 564 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  30.1 
 
 		 246 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2625  arginine transporter ATP-binding subunit  31.58 
 
 		 242 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1583  arginine transporter ATP-binding subunit  31.58 
 
 		 259 aa  45.4  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2710  arginine transporter ATP-binding subunit  31.58 
 
 		 259 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.387661  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2558  ABC transporter related  25.5 
 
 		 260 aa  45.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411241  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  22.34 
 
 		 531 aa  45.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  32.56 
 
 		 240 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0085  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  29 
 
 		 254 aa  44.7  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000203236  normal  0.523772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  29.52 
 
 		 261 aa  45.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2051  ABC transporter related protein  28.95 
 
 		 262 aa  45.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0751  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  27.83 
 
 		 337 aa  44.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.726044  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1061  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  26.8 
 
 		 330 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  29.11 
 
 		 247 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  28.19 
 
 		 388 aa  44.3  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  34.15 
 
 		 176 aa  44.3  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1595  arginine transport ATP-binding protein  31.48 
 
 		 250 aa  44.3  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.552324  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0590  arginine ABC transporter, ATP-binding protein  31.48 
 
 		 250 aa  44.3  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.501959  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3932  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  24.36 
 
 		 628 aa  44.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.47 
 
 		 244 aa  44.3  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 		 241 aa  44.3  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  33.77 
 
 		 241 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  33.77 
 
 		 241 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  33.77 
 
 		 241 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  30.61 
 
 		 263 aa  44.3  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  35.06 
 
 		 240 aa  44.3  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1458  hypothetical protein  26.98 
 
 		 431 aa  43.9  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1813  ABC transporter related  22.58 
 
 		 545 aa  43.9  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  36.62 
 
 		 643 aa  43.9  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  32.47 
 
 		 244 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.03 
 
 		 581 aa  43.9  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1018  hypothetical protein  29.05 
 
 		 606 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88989e-33 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1915  ABC transporter related  22.58 
 
 		 545 aa  43.9  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1162  ABC transporter related  38.24 
 
 		 245 aa  43.9  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.426993  normal  0.26857 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2303  ABC transporter related protein  29.11 
 
 		 246 aa  43.9  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000265903  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  25.49 
 
 		 328 aa  43.9  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.97058  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  28.45 
 
 		 250 aa  43.9  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000378719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  40 
 
 		 451 aa  43.9  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>