More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2276 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2276  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  512  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2376  ABC transporter related  91.16 
 
 		 249 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1702  arginine transporter ATP-binding subunit  86.35 
 
 		 249 aa  454  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0357255  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1968  arginine transporter ATP-binding subunit  85.94 
 
 		 249 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2710  arginine transporter ATP-binding subunit  82.33 
 
 		 259 aa  428  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.387661  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1656  arginine transporter ATP-binding subunit  84.3 
 
 		 242 aa  425  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.563363 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1583  arginine transporter ATP-binding subunit  81.93 
 
 		 259 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2625  arginine transporter ATP-binding subunit  83.47 
 
 		 242 aa  421  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00869  arginine transporter subunit  83.47 
 
 		 242 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.458857  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2778  ABC transporter related protein  83.47 
 
 		 242 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0132632  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2732  arginine transporter ATP-binding subunit  83.47 
 
 		 242 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.201208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0892  arginine transporter ATP-binding subunit  83.47 
 
 		 242 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.964935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2467  arginine transporter ATP-binding subunit  83.47 
 
 		 242 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1380  arginine transporter ATP-binding subunit  83.47 
 
 		 242 aa  415  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.374125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0968  arginine transporter ATP-binding subunit  83.47 
 
 		 242 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0937  arginine transporter ATP-binding subunit  83.47 
 
 		 242 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1024  arginine transporter ATP-binding subunit  83.47 
 
 		 242 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0928  arginine transporter ATP-binding subunit  81.4 
 
 		 242 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0995  arginine transporter ATP-binding subunit  81.4 
 
 		 242 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.938307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0963  arginine transporter ATP-binding subunit  81.4 
 
 		 242 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1045  arginine transporter ATP-binding subunit  81.4 
 
 		 242 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1026  arginine transporter ATP-binding subunit  81.4 
 
 		 242 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0251  arginine transporter ATP-binding subunit  66.67 
 
 		 269 aa  341  5.999999999999999e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000905563  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0323  arginine transporter ATP-binding subunit  69.01 
 
 		 242 aa  337  1.9999999999999998e-91  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0701  arginine transporter ATP-binding subunit  65.59 
 
 		 247 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001572  arginine ABC transporter ATP-binding protein ArtP  64.05 
 
 		 242 aa  319  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697194  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05528  arginine transporter ATP-binding subunit  63.16 
 
 		 247 aa  317  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  48.55 
 
 		 265 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  51.72 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  50.41 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1120  ABC transporter related  50 
 
 		 249 aa  233  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  49.8 
 
 		 259 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  51.97 
 
 		 256 aa  232  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  48.55 
 
 		 267 aa  231  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  50.44 
 
 		 252 aa  231  7.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  46.61 
 
 		 244 aa  230  1e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  49.2 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4555  ABC transporter related  47.54 
 
 		 299 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  46.91 
 
 		 252 aa  228  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0590  arginine ABC transporter, ATP-binding protein  46.72 
 
 		 250 aa  228  7e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.501959  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1595  arginine transport ATP-binding protein  46.72 
 
 		 250 aa  228  7e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.552324  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.79 
 
 		 592 aa  228  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.42 
 
 		 244 aa  228  8e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  44.4 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  45.83 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  45.64 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4859  ABC transporter related  45 
 
 		 266 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.430729 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  47.21 
 
 		 259 aa  225  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  47.08 
 
 		 256 aa  226  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1184  ABC transporter-related protein  46.59 
 
 		 275 aa  226  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  45.87 
 
 		 244 aa  225  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  46.06 
 
 		 246 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  47.88 
 
 		 249 aa  225  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  46.67 
 
 		 247 aa  224  7e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  46.86 
 
 		 261 aa  224  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  48.21 
 
 		 254 aa  224  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  46.06 
 
 		 247 aa  224  9e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  48.91 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  47.28 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  46.43 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1117  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  45.45 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000186599  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  46.06 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  46.06 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  47.11 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  45.71 
 
 		 263 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1445  ABC transporter related  46.75 
 
 		 249 aa  222  3e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.124868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  49.12 
 
 		 252 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  49.59 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  46.47 
 
 		 250 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05950  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.23 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  45.83 
 
 		 241 aa  222  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  46.93 
 
 		 244 aa  222  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  47.92 
 
 		 247 aa  222  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  45.64 
 
 		 241 aa  222  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0719  ABC transporter related  47.09 
 
 		 256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 242 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  45.23 
 
 		 246 aa  221  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0404  ABC transporter related  48.57 
 
 		 272 aa  221  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.6 
 
 		 581 aa  221  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  44.81 
 
 		 244 aa  221  8e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  44.81 
 
 		 265 aa  221  8e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  47.88 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 		 240 aa  220  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1702  ABC transporter related  45.08 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.478201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  46.47 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1061  polar amino acid ABC transporter ATPase  45.97 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  46.47 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  48.74 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 		 240 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  47.48 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1133  ABC transporter related  45.87 
 
 		 243 aa  219  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.010872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.47 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  47.88 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  47.72 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4140  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  47.88 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  44.63 
 
 		 249 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  49.15 
 
 		 267 aa  219  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  46.32 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  45.82 
 
 		 251 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>