More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1702 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1702  arginine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 249 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0357255  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1968  arginine transporter ATP-binding subunit  98.39 
 
 		 249 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2376  ABC transporter related  86.75 
 
 		 249 aa  462  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2276  ABC transporter related  86.35 
 
 		 249 aa  454  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1583  arginine transporter ATP-binding subunit  85.94 
 
 		 259 aa  448  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2710  arginine transporter ATP-binding subunit  86.35 
 
 		 259 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.387661  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1656  arginine transporter ATP-binding subunit  87.19 
 
 		 242 aa  443  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.563363 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2625  arginine transporter ATP-binding subunit  87.6 
 
 		 242 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00869  arginine transporter subunit  85.54 
 
 		 242 aa  434  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.458857  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2778  ABC transporter related protein  85.54 
 
 		 242 aa  434  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0132632  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2467  arginine transporter ATP-binding subunit  85.54 
 
 		 242 aa  434  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0892  arginine transporter ATP-binding subunit  85.54 
 
 		 242 aa  434  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.964935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0968  arginine transporter ATP-binding subunit  85.54 
 
 		 242 aa  434  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1024  arginine transporter ATP-binding subunit  85.54 
 
 		 242 aa  434  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0937  arginine transporter ATP-binding subunit  85.54 
 
 		 242 aa  434  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2732  arginine transporter ATP-binding subunit  85.54 
 
 		 242 aa  434  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.201208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1045  arginine transporter ATP-binding subunit  84.3 
 
 		 242 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0928  arginine transporter ATP-binding subunit  84.3 
 
 		 242 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0995  arginine transporter ATP-binding subunit  84.3 
 
 		 242 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.938307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1380  arginine transporter ATP-binding subunit  84.71 
 
 		 242 aa  429  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.374125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0963  arginine transporter ATP-binding subunit  84.3 
 
 		 242 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1026  arginine transporter ATP-binding subunit  84.3 
 
 		 242 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0251  arginine transporter ATP-binding subunit  69.11 
 
 		 269 aa  353  1e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000905563  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0323  arginine transporter ATP-binding subunit  69.83 
 
 		 242 aa  343  2e-93  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0701  arginine transporter ATP-binding subunit  64.37 
 
 		 247 aa  331  6e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001572  arginine ABC transporter ATP-binding protein ArtP  63.64 
 
 		 242 aa  322  4e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697194  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05528  arginine transporter ATP-binding subunit  62.75 
 
 		 247 aa  321  8e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4555  ABC transporter related  48.36 
 
 		 299 aa  238  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0590  arginine ABC transporter, ATP-binding protein  48.77 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.501959  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1595  arginine transport ATP-binding protein  48.77 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.552324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.26 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.26 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.26 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.26 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1061  polar amino acid ABC transporter ATPase  47.95 
 
 		 300 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136916  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  50.84 
 
 		 250 aa  231  6e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.26 
 
 		 250 aa  231  7.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  47.72 
 
 		 265 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  51.72 
 
 		 248 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05950  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.33 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  47.74 
 
 		 256 aa  229  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  51.09 
 
 		 256 aa  229  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.18 
 
 		 592 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.42 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  50.44 
 
 		 252 aa  229  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  46.44 
 
 		 247 aa  228  5e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  48.77 
 
 		 243 aa  228  6e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  46.67 
 
 		 248 aa  228  7e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  45.97 
 
 		 244 aa  228  7e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  46.89 
 
 		 255 aa  228  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 		 244 aa  228  9e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  49.17 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  46.47 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  45.2 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  48.74 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  46.31 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.56 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.63 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  45.97 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  47.5 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.32 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  47.01 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.4 
 
 		 581 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.56 
 
 		 244 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.56 
 
 		 244 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.56 
 
 		 244 aa  226  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  48.12 
 
 		 245 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1184  ABC transporter-related protein  46.59 
 
 		 275 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  47.3 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  49.34 
 
 		 255 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  46.61 
 
 		 244 aa  225  4e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  47.26 
 
 		 261 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 		 244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  46.47 
 
 		 267 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0719  ABC transporter related  47.75 
 
 		 256 aa  225  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.22 
 
 		 260 aa  225  6e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  47.33 
 
 		 252 aa  224  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1117  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  46.69 
 
 		 255 aa  224  8e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000186599  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.21 
 
 		 250 aa  224  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2622  ABC transporter related  46.25 
 
 		 241 aa  224  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  49.12 
 
 		 252 aa  224  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0894  ABC transporter related  47.5 
 
 		 242 aa  224  9e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213179  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1120  ABC transporter related  46 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  47.28 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.21 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  47.35 
 
 		 242 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  50.23 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  46.67 
 
 		 244 aa  224  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.21 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.21 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  46.47 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  47.93 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000214  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.72 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  44.76 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.58 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  48.02 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4859  ABC transporter related  44.58 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.430729 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  47.15 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  48.54 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>