More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0701 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0701  arginine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 247 aa  509  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05528  arginine transporter ATP-binding subunit  82.59 
 
 		 247 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001572  arginine ABC transporter ATP-binding protein ArtP  83.47 
 
 		 242 aa  422  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697194  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2376  ABC transporter related  65.59 
 
 		 249 aa  334  7.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1968  arginine transporter ATP-binding subunit  64.78 
 
 		 249 aa  332  4e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1702  arginine transporter ATP-binding subunit  64.37 
 
 		 249 aa  331  6e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0357255  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2276  ABC transporter related  65.59 
 
 		 249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1656  arginine transporter ATP-binding subunit  64.46 
 
 		 242 aa  326  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.563363 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2710  arginine transporter ATP-binding subunit  62.75 
 
 		 259 aa  318  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.387661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1583  arginine transporter ATP-binding subunit  62.75 
 
 		 259 aa  317  1e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2625  arginine transporter ATP-binding subunit  63.22 
 
 		 242 aa  316  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0251  arginine transporter ATP-binding subunit  61.79 
 
 		 269 aa  315  4e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000905563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00869  arginine transporter subunit  62.4 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.458857  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2778  ABC transporter related protein  62.4 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0132632  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0892  arginine transporter ATP-binding subunit  62.4 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.964935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2467  arginine transporter ATP-binding subunit  62.4 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0937  arginine transporter ATP-binding subunit  62.4 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1024  arginine transporter ATP-binding subunit  62.4 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2732  arginine transporter ATP-binding subunit  62.4 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.201208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0968  arginine transporter ATP-binding subunit  62.4 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1026  arginine transporter ATP-binding subunit  62.4 
 
 		 242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0963  arginine transporter ATP-binding subunit  62.4 
 
 		 242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0928  arginine transporter ATP-binding subunit  62.4 
 
 		 242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0995  arginine transporter ATP-binding subunit  62.4 
 
 		 242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.938307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1045  arginine transporter ATP-binding subunit  62.4 
 
 		 242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1380  arginine transporter ATP-binding subunit  62.4 
 
 		 242 aa  308  4e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.374125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0323  arginine transporter ATP-binding subunit  60.33 
 
 		 242 aa  288  6e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1120  ABC transporter related  47.18 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0595  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.95 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.062853  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  49.17 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  49.59 
 
 		 619 aa  241  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.97 
 
 		 581 aa  241  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1595  arginine transport ATP-binding protein  49.59 
 
 		 250 aa  241  7.999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.552324  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0590  arginine ABC transporter, ATP-binding protein  49.59 
 
 		 250 aa  241  7.999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.501959  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.77 
 
 		 597 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.5 
 
 		 244 aa  239  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.77 
 
 		 594 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.77 
 
 		 594 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  48.77 
 
 		 597 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.77 
 
 		 597 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 		 244 aa  238  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  47.72 
 
 		 240 aa  238  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.6 
 
 		 260 aa  238  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.95 
 
 		 592 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 		 244 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 		 244 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 		 244 aa  238  8e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  46.67 
 
 		 244 aa  237  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.36 
 
 		 595 aa  236  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  47.3 
 
 		 240 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  47.54 
 
 		 244 aa  235  4e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  44.49 
 
 		 258 aa  235  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1775  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  47.3 
 
 		 240 aa  234  7e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  normal  0.116362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  47.5 
 
 		 252 aa  234  8e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000214  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.67 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.47 
 
 		 240 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  47.92 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.25 
 
 		 244 aa  232  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.25 
 
 		 244 aa  232  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  46.28 
 
 		 255 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  47.08 
 
 		 240 aa  231  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.47 
 
 		 240 aa  231  7.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  47.33 
 
 		 253 aa  231  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  47.33 
 
 		 253 aa  231  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  47.06 
 
 		 247 aa  231  9e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  48.12 
 
 		 240 aa  231  9e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  46.44 
 
 		 242 aa  231  9e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  45.04 
 
 		 250 aa  231  9e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  46.89 
 
 		 240 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  47.76 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.64 
 
 		 240 aa  230  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  45.49 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  46.31 
 
 		 253 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  48.16 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  45.9 
 
 		 245 aa  230  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  44.9 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05950  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.42 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  46.03 
 
 		 242 aa  229  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4555  ABC transporter related  44.03 
 
 		 299 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  46.25 
 
 		 244 aa  229  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  47.5 
 
 		 258 aa  229  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  46.91 
 
 		 250 aa  228  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  45.42 
 
 		 268 aa  228  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.64 
 
 		 240 aa  228  7e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  48.33 
 
 		 264 aa  228  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.64 
 
 		 240 aa  228  9e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  45.64 
 
 		 240 aa  228  9e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.64 
 
 		 240 aa  228  9e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  42.04 
 
 		 254 aa  228  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  46.25 
 
 		 259 aa  228  9e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.64 
 
 		 240 aa  228  9e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.64 
 
 		 240 aa  228  9e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  45.64 
 
 		 240 aa  228  9e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5173  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  47.37 
 
 		 261 aa  227  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569594  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 		 240 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.64 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  45.71 
 
 		 602 aa  227  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.23 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>