96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003897 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  100 
 
 		 643 aa  1319    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3136  hypothetical protein  32.03 
 
 		 648 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.829641  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4877  AAA ATPase  29.59 
 
 		 591 aa  176  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0546065  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0454  AAA ATPase  27.17 
 
 		 606 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0896  hypothetical protein  31.64 
 
 		 672 aa  167  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.693496  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0608  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1404 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  44.74 
 
 		 680 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  30.2 
 
 		 604 aa  57.8  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.23 
 
 		 573 aa  55.5  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  28.49 
 
 		 666 aa  55.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1029  ABC transporter related  33.01 
 
 		 486 aa  53.9  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  22.5 
 
 		 595 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  30.34 
 
 		 567 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.77 
 
 		 652 aa  51.6  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2274  AAA ATPase  23.89 
 
 		 602 aa  51.6  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.363979 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.92 
 
 		 607 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  31.58 
 
 		 564 aa  50.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  32.98 
 
 		 572 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1946  ABC transporter related protein  27.88 
 
 		 744 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.21 
 
 		 429 aa  49.7  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1821  ABC transporter related  32.5 
 
 		 243 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0936228  hitchhiker  0.0000000174264 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  30.34 
 
 		 623 aa  48.9  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1748  type I secretion system ATPase  31.25 
 
 		 571 aa  48.9  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.492562  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1297  ABC transporter related  30.33 
 
 		 249 aa  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  31.03 
 
 		 540 aa  48.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2562  ABC transporter, ATP-binding protein  27.95 
 
 		 274 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  29.21 
 
 		 484 aa  48.5  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  32.77 
 
 		 619 aa  48.1  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  31.54 
 
 		 579 aa  47.8  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3424  ABC transporter related  36.26 
 
 		 328 aa  47.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3531  ABC transporter related protein  27.46 
 
 		 341 aa  47.8  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.41 
 
 		 310 aa  47.4  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  30.66 
 
 		 712 aa  47.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  36.84 
 
 		 564 aa  47.4  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6489  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  28.7 
 
 		 252 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  30.48 
 
 		 247 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  22.69 
 
 		 423 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.22 
 
 		 595 aa  47  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  24.55 
 
 		 642 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2711  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  26.87 
 
 		 581 aa  46.2  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0138021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  30.39 
 
 		 254 aa  46.2  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.57 
 
 		 642 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  29.47 
 
 		 357 aa  46.6  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3724  ABC transporter related  35.16 
 
 		 328 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.16 
 
 		 337 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2238  ABC transporter related  27.55 
 
 		 246 aa  45.8  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0769136  normal  0.0562594 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0006  ABC transporter related  26.59 
 
 		 273 aa  46.6  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.257411  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0117  ATPase  25.16 
 
 		 312 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182044  hitchhiker  0.000782511 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  37.14 
 
 		 240 aa  45.4  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2120  spermidine/putrescine import ATP-binding protein  32.35 
 
 		 376 aa  45.8  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2786  ABC transporter related  33.7 
 
 		 251 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00998807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  32 
 
 		 234 aa  45.8  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  29.59 
 
 		 235 aa  45.8  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  29.61 
 
 		 628 aa  45.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3441  ABC transporter related  25.76 
 
 		 269 aa  45.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  32.61 
 
 		 234 aa  45.8  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  30.48 
 
 		 247 aa  45.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0326  ABC transporter related  26.32 
 
 		 372 aa  45.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.06 
 
 		 277 aa  45.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  30.84 
 
 		 254 aa  45.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  30.77 
 
 		 256 aa  45.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  32.61 
 
 		 234 aa  45.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3154  ABC transporter related  31.4 
 
 		 252 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0779232 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.06 
 
 		 285 aa  44.7  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3138  ABC transporter related  31.4 
 
 		 252 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19580  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  32.18 
 
 		 274 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0114  cell division ATP-binding protein FtsE  33.87 
 
 		 235 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  28.87 
 
 		 248 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0063  ABC transporter related  31.52 
 
 		 238 aa  44.7  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.270537 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.06 
 
 		 285 aa  44.7  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1685  ABC transporter related  25.78 
 
 		 239 aa  44.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  28.87 
 
 		 244 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  31.58 
 
 		 416 aa  44.3  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2906  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  25.13 
 
 		 726 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.452451  normal  0.0897932 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1447  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  31.11 
 
 		 229 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.912027  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0576  ABC transporter related  34.29 
 
 		 264 aa  44.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.490377  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1285  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  31.11 
 
 		 232 aa  44.7  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  30.39 
 
 		 254 aa  44.7  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1685  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  32.18 
 
 		 274 aa  44.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2611  hypothetical protein  28.87 
 
 		 668 aa  44.3  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747487  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  29.41 
 
 		 431 aa  44.3  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  39.71 
 
 		 802 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2837  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  25.13 
 
 		 726 aa  44.3  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2888  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  25.13 
 
 		 726 aa  44.3  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2907  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  25.13 
 
 		 726 aa  44.3  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  23.47 
 
 		 585 aa  44.3  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2827  ABC transporter, ATPase subunit  30.68 
 
 		 248 aa  43.9  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  27.08 
 
 		 613 aa  43.9  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  36.62 
 
 		 540 aa  43.9  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  29.46 
 
 		 442 aa  43.9  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1976  ABC transporter related  35.85 
 
 		 210 aa  43.9  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.0800392 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  27.72 
 
 		 342 aa  43.9  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1502  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  30 
 
 		 232 aa  43.9  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.142309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3977  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  26.67 
 
 		 235 aa  43.9  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.099286  decreased coverage  0.00201124 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0129  ABC transporter related  32.86 
 
 		 264 aa  43.9  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  30.12 
 
 		 516 aa  43.9  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>