34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2345 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  100 
 
 		 516 aa  1068    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  58.9 
 
 		 513 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  38.77 
 
 		 540 aa  307  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10058  ea59  45.26 
 
 		 312 aa  216  9e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.107318  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00755  hypothetical protein  45.26 
 
 		 290 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.137784  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05619  hypothetical protein  42.46 
 
 		 254 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  29.58 
 
 		 484 aa  172  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1567  AAA ATPase  25.42 
 
 		 556 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  25.18 
 
 		 567 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1204  hypothetical protein  24.03 
 
 		 567 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530833  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  23.3 
 
 		 540 aa  86.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  27.4 
 
 		 601 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  30 
 
 		 584 aa  51.2  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  32.1 
 
 		 457 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  32.93 
 
 		 352 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  31.07 
 
 		 418 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  32.93 
 
 		 353 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  38.46 
 
 		 251 aa  47.4  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  33.77 
 
 		 451 aa  47.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  22.22 
 
 		 486 aa  46.6  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.79 
 
 		 669 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  28.99 
 
 		 586 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  38.55 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.33 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  34.94 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  34.18 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  27.35 
 
 		 556 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  24.59 
 
 		 588 aa  44.3  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  31.82 
 
 		 228 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  30.77 
 
 		 442 aa  43.9  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0565  hypothetical protein  30.26 
 
 		 556 aa  43.5  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  23.75 
 
 		 597 aa  43.5  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  30.12 
 
 		 643 aa  43.5  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  32.91 
 
 		 457 aa  43.5  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>