27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0737 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  100 
 
 		 509 aa  1054    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  36.82 
 
 		 519 aa  290  4e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  35.73 
 
 		 506 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0391  hypothetical protein  43.26 
 
 		 571 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000199178 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  28.99 
 
 		 588 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  29.94 
 
 		 601 aa  64.7  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  29.75 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  28.89 
 
 		 556 aa  60.8  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  33.12 
 
 		 540 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1204  hypothetical protein  37.23 
 
 		 567 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530833  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  24.11 
 
 		 530 aa  50.1  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  26.64 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  31.34 
 
 		 567 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1567  AAA ATPase  26.38 
 
 		 556 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  26.87 
 
 		 532 aa  47.4  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  31.52 
 
 		 484 aa  47.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  28.57 
 
 		 540 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  31.94 
 
 		 440 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  23.88 
 
 		 422 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  30.4 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  26.05 
 
 		 582 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  25 
 
 		 619 aa  44.3  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  29.21 
 
 		 562 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  24.67 
 
 		 452 aa  43.9  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  27.35 
 
 		 251 aa  43.9  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  22.77 
 
 		 712 aa  43.5  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  26.96 
 
 		 461 aa  43.5  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>