69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3524 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  26.09 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  44.59 
 
 		 452 aa  65.9  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  36.57 
 
 		 461 aa  65.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  29.33 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  35 
 
 		 532 aa  62  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  39.77 
 
 		 427 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  24.26 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  38.16 
 
 		 423 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  42.03 
 
 		 443 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  35.71 
 
 		 336 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  36.26 
 
 		 455 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  40.54 
 
 		 976 aa  52  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  36.11 
 
 		 450 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  32.32 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  32.47 
 
 		 519 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1567  AAA ATPase  24.85 
 
 		 556 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  32.39 
 
 		 284 aa  48.9  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0853  ATPase  32.53 
 
 		 445 aa  48.9  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  28.3 
 
 		 276 aa  48.5  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  30.39 
 
 		 586 aa  48.5  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1645  ATPase  42.03 
 
 		 451 aa  47.8  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4743  hypothetical protein  26.96 
 
 		 478 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311034 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  30.39 
 
 		 540 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  27.43 
 
 		 588 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  33.8 
 
 		 457 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  33.33 
 
 		 513 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  28.83 
 
 		 452 aa  47  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.55 
 
 		 429 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  32.53 
 
 		 712 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  35 
 
 		 597 aa  45.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  31.94 
 
 		 446 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  32.73 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  33.8 
 
 		 448 aa  45.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  31.43 
 
 		 486 aa  44.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  29.55 
 
 		 482 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  36.51 
 
 		 666 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  29.86 
 
 		 530 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  31.82 
 
 		 540 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  27.88 
 
 		 451 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  40.74 
 
 		 619 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  31.82 
 
 		 516 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  31.25 
 
 		 323 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  34.62 
 
 		 437 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  29.29 
 
 		 394 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  39.71 
 
 		 368 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  32.47 
 
 		 562 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  26.79 
 
 		 449 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3405  ATP-binding protein  36.84 
 
 		 454 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00177365  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0512  ABC transporter, ATP-binding protein  34.25 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  30.95 
 
 		 642 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1261  ABC transporter, ATP-binding protein  30.69 
 
 		 227 aa  42.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0586  ABC transporter ATP-binding protein  30.07 
 
 		 303 aa  42.4  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0943  hypothetical protein  25.21 
 
 		 565 aa  42.4  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000190881  hitchhiker  0.00360431 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  33.33 
 
 		 285 aa  42.4  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.77 
 
 		 573 aa  42.4  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  31.52 
 
 		 607 aa  42  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2495  hypothetical protein  21.37 
 
 		 630 aa  42  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  29.35 
 
 		 403 aa  42  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4468  ABC transporter related  30.39 
 
 		 258 aa  42  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  31.94 
 
 		 455 aa  42  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2107  type I secretion system ATPase  33.33 
 
 		 575 aa  42  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  42.55 
 
 		 634 aa  42  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  27.55 
 
 		 506 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1999  ABC transporter related  32.69 
 
 		 571 aa  41.6  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0994183  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33590  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  43.48 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.14808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  31.87 
 
 		 452 aa  41.6  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1204  hypothetical protein  28.15 
 
 		 567 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530833  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  34.25 
 
 		 680 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>