62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3120 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  100 
 
 		 284 aa  581  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  61.75 
 
 		 285 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  26.69 
 
 		 264 aa  89.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  29.44 
 
 		 253 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  25.69 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  25.4 
 
 		 269 aa  86.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  26.4 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  27.89 
 
 		 238 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  26.82 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  29.44 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  25.88 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  27.89 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  28.51 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  25.4 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  22.98 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  27.02 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  24.7 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  25.3 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  27.31 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  43.75 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  24.7 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  25.3 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  25.1 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  24.8 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  25.3 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  25.2 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  25.2 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  34.41 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  32.98 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  40.4 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  26.07 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  21.83 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  26.21 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  39.33 
 
 		 242 aa  67  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  43.59 
 
 		 246 aa  67  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  23.91 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  30.93 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  23.75 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  32.32 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  31.87 
 
 		 457 aa  55.8  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  29 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  27.84 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  28.23 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  43.33 
 
 		 176 aa  53.9  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  43.33 
 
 		 532 aa  52.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  21.34 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  32.39 
 
 		 228 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  23.85 
 
 		 540 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  36.54 
 
 		 642 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  46 
 
 		 695 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0280  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  26.15 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  34.29 
 
 		 449 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  34.72 
 
 		 450 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  31.87 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  34.29 
 
 		 461 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0500  ABC transporter related  21.97 
 
 		 533 aa  43.9  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  26.5 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  34.78 
 
 		 482 aa  43.5  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0144  putative ABC transporter ATP-binding protein  22.64 
 
 		 553 aa  43.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  40.38 
 
 		 429 aa  42.7  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  42.86 
 
 		 414 aa  42.7  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3277  ABC transporter, ATP-binding protein Uup  26.56 
 
 		 645 aa  42  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>