63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3230 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  922    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  30.15 
 
 		 442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  28.92 
 
 		 431 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  26.17 
 
 		 416 aa  153  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  47.89 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  35.09 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  24.32 
 
 		 513 aa  61.6  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0350  putative ATP-binding protein  29.83 
 
 		 358 aa  59.7  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  normal  0.712412 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  33.98 
 
 		 339 aa  59.7  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  30.56 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  23.75 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3733  hypothetical protein  29.37 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  27.36 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  51.06 
 
 		 496 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  32.41 
 
 		 378 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  27.42 
 
 		 465 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  27.43 
 
 		 429 aa  50.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  26.21 
 
 		 446 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  36.51 
 
 		 457 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  37.74 
 
 		 176 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  27.05 
 
 		 572 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  30 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  38.89 
 
 		 530 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  25.53 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  32.76 
 
 		 497 aa  47.8  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  32.14 
 
 		 369 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  26.72 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  33.77 
 
 		 516 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1140  putative ATP-binding protein  26.21 
 
 		 349 aa  47.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  33.33 
 
 		 378 aa  47  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  41.3 
 
 		 448 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  36.36 
 
 		 533 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  39.06 
 
 		 459 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  44 
 
 		 564 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  29.93 
 
 		 224 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  29.63 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3188  putative ATP-binding protein  32.56 
 
 		 344 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.636765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  25.24 
 
 		 457 aa  45.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.31 
 
 		 626 aa  44.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  23.47 
 
 		 408 aa  44.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  37.31 
 
 		 626 aa  44.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3360  hypothetical protein  32.08 
 
 		 437 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  30.88 
 
 		 371 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0471  hypothetical protein  28.04 
 
 		 533 aa  44.3  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0692558  decreased coverage  0.00000000612882 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  30.39 
 
 		 457 aa  43.9  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.68 
 
 		 603 aa  44.3  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  29.03 
 
 		 441 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  40 
 
 		 540 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  39.34 
 
 		 391 aa  43.9  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  31.75 
 
 		 532 aa  43.9  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  27.88 
 
 		 228 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  34.69 
 
 		 623 aa  43.9  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4743  hypothetical protein  40 
 
 		 478 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311034 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  30.32 
 
 		 380 aa  43.5  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  25.47 
 
 		 450 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  42.22 
 
 		 579 aa  43.5  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  38.46 
 
 		 455 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0541267 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  31.37 
 
 		 495 aa  43.5  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  36.73 
 
 		 467 aa  43.5  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  29.11 
 
 		 374 aa  43.5  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.24 
 
 		 652 aa  43.1  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  31.65 
 
 		 399 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  37.04 
 
 		 363 aa  43.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0529287 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>