54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3188 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3188  putative ATP-binding protein  100 
 
 		 344 aa  709    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.636765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0648  AAA ATPase  38.82 
 
 		 340 aa  246  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0666  DNA replication and repair protein RecF  37.95 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0186794  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0568  DNA replication and repair protein RecF  35.17 
 
 		 340 aa  206  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2687  putative ATP-binding protein  33.52 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.815306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5454  ATP-binding protein  31.55 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.696652  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1679  hypothetical protein  30.75 
 
 		 351 aa  170  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489043 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1140  putative ATP-binding protein  33.91 
 
 		 349 aa  165  9e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2637  putative ATP-binding protein  32.67 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592528  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  28.21 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3733  hypothetical protein  27.14 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0350  putative ATP-binding protein  27.97 
 
 		 358 aa  98.6  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  normal  0.712412 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  24.73 
 
 		 339 aa  90.1  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  23.66 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  28.75 
 
 		 416 aa  57  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  28.16 
 
 		 442 aa  52.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6646  ABC transporter related  26.06 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0373686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6413  ABC transporter related  26.06 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00239235  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1650  ABC transporter related protein  32.26 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0762596  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4530  ABC transporter related  33.7 
 
 		 242 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.286786  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6244  ABC transporter related  27.12 
 
 		 261 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.461474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  33.33 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  32.56 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2090  ABC transporter component  25.53 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.810567  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  30.91 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  33.33 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  22.86 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3389  ABC transporter related  25.42 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  32.29 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  30 
 
 		 266 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0703  hypothetical protein  21.01 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2407  ABC transporter related  29.45 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2245  ABC transporter related  23.79 
 
 		 249 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0732  hypothetical protein  21.01 
 
 		 399 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  30 
 
 		 260 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  41.86 
 
 		 258 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4441  ABC transporter related  41.86 
 
 		 255 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  41.86 
 
 		 258 aa  44.3  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  32.43 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4755  ABC transporter, ATP-binding protein  26.11 
 
 		 242 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2258  ABC transporter related  33.9 
 
 		 286 aa  43.5  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.633697 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  27.97 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  37.74 
 
 		 247 aa  43.1  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3028  ABC transporter related protein  30.77 
 
 		 226 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.166438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00170  putative ATP-binding protein involved in cell division  32.79 
 
 		 229 aa  43.1  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  27.27 
 
 		 1199 aa  43.1  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  27.27 
 
 		 1194 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1353  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  43.1  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.67 
 
 		 334 aa  43.1  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  28.8 
 
 		 574 aa  42.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  28.04 
 
 		 309 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  21.13 
 
 		 341 aa  42.7  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5526  ABC transporter ATP-binding protein  32 
 
 		 280 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5133  ABC transporter ATP-binding protein  32 
 
 		 280 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.907732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>