54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1140 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1140  putative ATP-binding protein  100 
 
 		 349 aa  721    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2637  putative ATP-binding protein  67.72 
 
 		 353 aa  498  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592528  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2687  putative ATP-binding protein  34.31 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.815306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0350  putative ATP-binding protein  34.44 
 
 		 358 aa  189  5e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  normal  0.712412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5454  ATP-binding protein  33.52 
 
 		 356 aa  172  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.696652  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1679  hypothetical protein  34.75 
 
 		 351 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489043 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0666  DNA replication and repair protein RecF  31.96 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0186794  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3188  putative ATP-binding protein  33.91 
 
 		 344 aa  165  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.636765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0648  AAA ATPase  31.02 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0568  DNA replication and repair protein RecF  30.06 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  35.25 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  27.51 
 
 		 339 aa  116  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3733  hypothetical protein  38.04 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  26.43 
 
 		 442 aa  53.9  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  25.15 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  39.68 
 
 		 250 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  45.61 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  26.21 
 
 		 451 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  30.28 
 
 		 301 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1627  ABC transporter related  42.86 
 
 		 252 aa  46.6  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.868529  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1135  hypothetical protein  40 
 
 		 447 aa  46.6  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.879789  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  34.29 
 
 		 529 aa  46.2  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2058  ABC transporter, ATPase subunit  41.27 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2348  hypothetical protein  26.32 
 
 		 461 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2848  SMC domain protein  47.5 
 
 		 533 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0659  ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  32.23 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  51.28 
 
 		 586 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  51.28 
 
 		 586 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0121  ABC transporter related  34.33 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  36.67 
 
 		 581 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  30 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3425  ABC transporter related protein  38.57 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458573  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0323  arginine transporter ATP-binding subunit  41.07 
 
 		 242 aa  44.3  0.003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0777  SMC domain-containing protein  45 
 
 		 539 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397479  normal  0.58729 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  40.43 
 
 		 565 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1317  hypothetical protein  22.55 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.361107  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  31.15 
 
 		 373 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1216  SMC domain protein  45 
 
 		 531 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2596  DNA repair protein RecN  45 
 
 		 537 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  36.36 
 
 		 339 aa  43.9  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  42.86 
 
 		 368 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  21.91 
 
 		 495 aa  43.9  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  28.08 
 
 		 457 aa  43.5  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  36.73 
 
 		 369 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  36.96 
 
 		 440 aa  43.1  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2068  ABC transporter related  28.57 
 
 		 247 aa  43.1  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  23.4 
 
 		 459 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  30.77 
 
 		 452 aa  43.1  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  34.92 
 
 		 245 aa  42.7  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  47.22 
 
 		 560 aa  42.7  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  40 
 
 		 373 aa  42.7  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0021  SMC domain protein  42.5 
 
 		 533 aa  42.7  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>