132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0568 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0568  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 		 340 aa  709    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0666  DNA replication and repair protein RecF  43.79 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0186794  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3188  putative ATP-binding protein  35.17 
 
 		 344 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.636765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0648  AAA ATPase  35.5 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2687  putative ATP-binding protein  31.93 
 
 		 355 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.815306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5454  ATP-binding protein  32.02 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.696652  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1679  hypothetical protein  31.53 
 
 		 351 aa  170  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489043 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1140  putative ATP-binding protein  30.06 
 
 		 349 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2637  putative ATP-binding protein  31.56 
 
 		 353 aa  149  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592528  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  28.16 
 
 		 355 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0350  putative ATP-binding protein  29.51 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  normal  0.712412 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  24.44 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3733  hypothetical protein  35 
 
 		 348 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  25.34 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03583  recombination protein F  47.73 
 
 		 357 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.517201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0003  DNA replication and repair protein RecF  47.73 
 
 		 357 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.877523  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3913  recombination protein F  47.73 
 
 		 357 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00221081  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4210  recombination protein F  47.73 
 
 		 357 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000837842  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03527  hypothetical protein  47.73 
 
 		 357 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0003  recombination protein F  47.73 
 
 		 357 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0566679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4065  recombination protein F  47.73 
 
 		 357 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0837895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4225  recombination protein F  47.73 
 
 		 357 aa  49.7  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.164466  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4121  recombination protein F  47.73 
 
 		 357 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.976477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4170  recombination protein F  47.73 
 
 		 357 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0248786  normal  0.357156 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5128  recombination protein F  47.73 
 
 		 357 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.010515  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4048  recombination protein F  47.73 
 
 		 357 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4064  recombination protein F  47.73 
 
 		 357 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4228  recombination protein F  47.73 
 
 		 357 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0003  recombination protein F  47.73 
 
 		 357 aa  49.3  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000748335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0034  recombination protein F  45.45 
 
 		 361 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000927918  normal  0.243305 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00030  DNA replication and repair protein RecF  30.17 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  47.62 
 
 		 377 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0003  recombination protein F  47.73 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0385213  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  25.93 
 
 		 416 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0003  recombination protein F  47.73 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0661286  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.45 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0003  recombination protein F  45.45 
 
 		 361 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0003  recombination protein F  45.45 
 
 		 361 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0110624  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  27.13 
 
 		 549 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  27.13 
 
 		 549 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  27.13 
 
 		 549 aa  47  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  26.36 
 
 		 549 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  26.36 
 
 		 549 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  27.13 
 
 		 549 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  27.13 
 
 		 549 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  27.13 
 
 		 549 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  27.13 
 
 		 549 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  27.13 
 
 		 549 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  26.36 
 
 		 549 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  44.44 
 
 		 368 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3722  DNA replication and repair protein RecF  44.19 
 
 		 385 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000891221  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  26.36 
 
 		 549 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  48.84 
 
 		 371 aa  46.6  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  46.15 
 
 		 371 aa  46.6  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0004  DNA replication and repair protein RecF  43.9 
 
 		 457 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470302 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0004  recombination protein F  46.15 
 
 		 399 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000897119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  48.65 
 
 		 401 aa  46.2  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  50 
 
 		 380 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  34.29 
 
 		 333 aa  46.2  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  37.5 
 
 		 577 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  50 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  50 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  31.51 
 
 		 374 aa  45.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  23.64 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  43.18 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  25.58 
 
 		 549 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  50 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000215476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  32.88 
 
 		 601 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  39.58 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  43.48 
 
 		 375 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  39.02 
 
 		 415 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  29.25 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2787  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  28.97 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0212634  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3874  ABC transporter related  30.56 
 
 		 254 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  30.17 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1476  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  28.97 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.307968  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  32.31 
 
 		 553 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4151  recombination protein F  43.18 
 
 		 361 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000332755  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0298  DNA repair protein RecN  35.38 
 
 		 506 aa  44.3  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  23.64 
 
 		 249 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4175  recombination protein F  43.18 
 
 		 361 aa  44.3  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0239408  normal  0.0132322 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  42.86 
 
 		 572 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0003  recombination protein F  43.18 
 
 		 361 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  25.58 
 
 		 549 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  30.17 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  41.3 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  41.3 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  41.3 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  46.15 
 
 		 401 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  25 
 
 		 273 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  41.3 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0776  DNA repair protein RecN  37.21 
 
 		 611 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163902  normal  0.739738 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4051  ABC transporter related protein  30.56 
 
 		 254 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  24 
 
 		 267 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  24.55 
 
 		 249 aa  43.9  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.26 
 
 		 397 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  41.3 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  41.3 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  41.3 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  41.3 
 
 		 375 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>