More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0666 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0666  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 		 333 aa  683    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0186794  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0568  DNA replication and repair protein RecF  43.79 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3188  putative ATP-binding protein  37.95 
 
 		 344 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.636765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0648  AAA ATPase  39.82 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2637  putative ATP-binding protein  35.36 
 
 		 353 aa  192  8e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592528  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2687  putative ATP-binding protein  31.49 
 
 		 355 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.815306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5454  ATP-binding protein  34.21 
 
 		 356 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.696652  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1140  putative ATP-binding protein  31.96 
 
 		 349 aa  166  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1679  hypothetical protein  33.05 
 
 		 351 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489043 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0350  putative ATP-binding protein  31.36 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  normal  0.712412 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  28.23 
 
 		 355 aa  122  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  30.16 
 
 		 323 aa  115  8.999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3733  hypothetical protein  32.58 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  23.63 
 
 		 339 aa  87  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 273 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  23.96 
 
 		 349 aa  49.7  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_002620  TC0023  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 239 aa  49.7  0.00008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  40 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6416  ABC transporter related  41.82 
 
 		 702 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00507697  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  23.24 
 
 		 460 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3629  ABC transporter related  35.11 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00141619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  23.24 
 
 		 460 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  31.96 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13310  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 255 aa  47.4  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  36.96 
 
 		 266 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  28.57 
 
 		 442 aa  47.4  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  32.14 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  37.78 
 
 		 266 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  35.38 
 
 		 250 aa  47  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4573  ABC transporter related  30.77 
 
 		 245 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.958024  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3307  ABC transporter related  33.72 
 
 		 256 aa  47  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  36.17 
 
 		 265 aa  46.6  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  36.96 
 
 		 243 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  29.79 
 
 		 244 aa  46.6  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  31.82 
 
 		 246 aa  46.6  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0528  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  34.78 
 
 		 258 aa  46.2  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191469  normal  0.015863 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3745  cell division ATP-binding protein FtsE  38.3 
 
 		 224 aa  46.6  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3697  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  37.78 
 
 		 242 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270266  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02231  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  35.53 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.985627  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1350  ABC transporter related protein  35.53 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318832  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  38.3 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2003  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  29.03 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  36.17 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  33.33 
 
 		 264 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2456  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  35.53 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180291  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2592  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  40.43 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1154  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  37.78 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2701  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  40.43 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.91 
 
 		 533 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.429641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0887  ABC transporter related  38.3 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000314613  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  38.3 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02191  hypothetical protein  35.53 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  36.96 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  28.7 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.96 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2492  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  40.43 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.793796  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3446  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  35.53 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2155  cell division ATP-binding protein FtsE  24.41 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4158  ABC transporter related  36.17 
 
 		 254 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  40 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4008  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  36 
 
 		 230 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  40 
 
 		 254 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  38.3 
 
 		 260 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6912  ABC transporter related  36.17 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0868  amino acid ABC transporter permease  40.91 
 
 		 532 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  36.17 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1346  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  35.53 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.281005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  37.78 
 
 		 264 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2600  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  35.53 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0142427  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2538  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  40.43 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2580  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  40.43 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.676694  normal  0.169811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  38.3 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0139  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  33.93 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2462  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  35.53 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.460847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5919  ABC transporter related  36.17 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4468  ABC transporter related  32 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  36.17 
 
 		 252 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  34.04 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  31.33 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0885  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.91 
 
 		 533 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0599  ABC transporter related protein  36.96 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2684  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  35.53 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.186736  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4412  ABC transporter related  35.56 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912438 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  32.81 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  40 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  37.78 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4288  ABC transporter-like  36.17 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  36.17 
 
 		 240 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1431  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  39.58 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000341956  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2565  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  39.58 
 
 		 257 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0952692  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  36.17 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  32 
 
 		 240 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1533  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.25 
 
 		 230 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0016393  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0350  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  39.58 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00950632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1326  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  34.92 
 
 		 224 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00202855  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0105  ABC transporter  31.03 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.252564  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  30.68 
 
 		 268 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1445  ABC transporter related  28.12 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.124868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  39.13 
 
 		 244 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>