More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2596 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2596  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 537 aa  1078    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0923  SMC domain protein  63.27 
 
 		 550 aa  637    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.757485 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0777  SMC domain-containing protein  61.77 
 
 		 539 aa  630  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397479  normal  0.58729 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1216  SMC domain protein  56.23 
 
 		 531 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0021  SMC domain protein  49.91 
 
 		 533 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2848  SMC domain protein  50.29 
 
 		 533 aa  463  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  35.6 
 
 		 554 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  34.6 
 
 		 554 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  32.68 
 
 		 577 aa  261  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  33.75 
 
 		 556 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  32.38 
 
 		 580 aa  253  8.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  34.15 
 
 		 578 aa  250  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  35.19 
 
 		 553 aa  249  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  35.8 
 
 		 553 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  34.06 
 
 		 558 aa  244  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  31.9 
 
 		 573 aa  243  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  34.29 
 
 		 586 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  35.73 
 
 		 553 aa  240  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  31.76 
 
 		 555 aa  240  5.999999999999999e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  31.32 
 
 		 572 aa  232  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  29.91 
 
 		 552 aa  232  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1612  DNA repair protein RecN  35.14 
 
 		 573 aa  232  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.458504 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  30.59 
 
 		 579 aa  231  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  36.89 
 
 		 547 aa  231  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  30.41 
 
 		 579 aa  230  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  30.41 
 
 		 579 aa  230  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  30.41 
 
 		 579 aa  230  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  31.99 
 
 		 572 aa  230  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  32.01 
 
 		 567 aa  229  9e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  30.85 
 
 		 579 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  30.23 
 
 		 583 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  30.23 
 
 		 583 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  30.23 
 
 		 579 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  30.23 
 
 		 579 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1475  DNA repair protein RecN  33.09 
 
 		 554 aa  228  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.460183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  30.41 
 
 		 579 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  32.01 
 
 		 566 aa  227  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  31.15 
 
 		 573 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  30.87 
 
 		 559 aa  226  8e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  31.25 
 
 		 565 aa  225  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  33.09 
 
 		 549 aa  226  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  31.4 
 
 		 582 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  30.52 
 
 		 579 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  32.79 
 
 		 553 aa  225  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  29.19 
 
 		 562 aa  224  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 559 aa  224  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  32.85 
 
 		 558 aa  223  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  31.19 
 
 		 575 aa  222  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  30.25 
 
 		 570 aa  221  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  32.3 
 
 		 568 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  31.97 
 
 		 560 aa  221  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  33.21 
 
 		 551 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  34.42 
 
 		 546 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  31.41 
 
 		 574 aa  221  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  32.53 
 
 		 555 aa  219  7.999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  31.99 
 
 		 568 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  30.92 
 
 		 557 aa  219  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  30.67 
 
 		 555 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  34.42 
 
 		 546 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  32.09 
 
 		 601 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  31.34 
 
 		 555 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  30.09 
 
 		 559 aa  218  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  30.09 
 
 		 559 aa  218  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  28.85 
 
 		 565 aa  217  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  31.91 
 
 		 565 aa  217  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 595 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  29.33 
 
 		 568 aa  217  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  32.18 
 
 		 559 aa  216  8e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  32.72 
 
 		 554 aa  215  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  31.17 
 
 		 556 aa  216  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  33.04 
 
 		 565 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  31.62 
 
 		 605 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  32.17 
 
 		 569 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0776  DNA repair protein RecN  31.38 
 
 		 611 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163902  normal  0.739738 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  35.39 
 
 		 529 aa  214  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  31.99 
 
 		 559 aa  213  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  29.58 
 
 		 555 aa  213  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  33.09 
 
 		 553 aa  213  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  28.65 
 
 		 565 aa  213  7e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  31.43 
 
 		 566 aa  213  9e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217727 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  31.33 
 
 		 553 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  31.86 
 
 		 567 aa  213  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  28.75 
 
 		 551 aa  212  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  31.33 
 
 		 553 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  31.12 
 
 		 553 aa  212  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 561 aa  212  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  31.11 
 
 		 589 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  31.15 
 
 		 553 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  32.61 
 
 		 558 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  31.85 
 
 		 556 aa  211  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  32.99 
 
 		 593 aa  211  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  32.42 
 
 		 553 aa  211  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  31.15 
 
 		 553 aa  211  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  33.21 
 
 		 549 aa  210  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  31.15 
 
 		 553 aa  211  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  31.15 
 
 		 553 aa  211  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  30.59 
 
 		 566 aa  210  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  33.15 
 
 		 558 aa  209  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  27.27 
 
 		 574 aa  209  7e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  31.24 
 
 		 557 aa  209  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>