More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0587 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  100 
 
 		 560 aa  1113    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  39.65 
 
 		 562 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  38.89 
 
 		 565 aa  362  8e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  39.53 
 
 		 567 aa  355  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  39.82 
 
 		 566 aa  353  5e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  37.46 
 
 		 570 aa  352  8e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  37.57 
 
 		 580 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  38.24 
 
 		 565 aa  335  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  38.08 
 
 		 599 aa  334  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  35.69 
 
 		 559 aa  333  5e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  35.91 
 
 		 555 aa  333  7.000000000000001e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  40 
 
 		 572 aa  332  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  36.21 
 
 		 587 aa  330  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  35.83 
 
 		 579 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  34.29 
 
 		 558 aa  327  3e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  36.25 
 
 		 601 aa  327  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  35.43 
 
 		 579 aa  327  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  35.43 
 
 		 579 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  35.25 
 
 		 579 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  35.19 
 
 		 579 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  35.25 
 
 		 579 aa  326  9e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  35.08 
 
 		 583 aa  325  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  36.19 
 
 		 555 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  35.25 
 
 		 579 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  36.56 
 
 		 577 aa  325  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  35.25 
 
 		 559 aa  324  3e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  35.08 
 
 		 583 aa  324  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  35.25 
 
 		 559 aa  324  3e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  35.08 
 
 		 579 aa  323  5e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  35.08 
 
 		 579 aa  323  5e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  37.11 
 
 		 586 aa  323  8e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  35.78 
 
 		 556 aa  322  9.000000000000001e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  36.65 
 
 		 558 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  38.35 
 
 		 558 aa  319  7e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  35.47 
 
 		 557 aa  316  6e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  37.16 
 
 		 554 aa  316  8e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  35.73 
 
 		 560 aa  316  8e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  36.08 
 
 		 588 aa  315  9e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  36.57 
 
 		 557 aa  313  5.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  36.64 
 
 		 572 aa  313  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 565 aa  313  6.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  36.24 
 
 		 588 aa  313  7.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 573 aa  312  9e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  33.75 
 
 		 555 aa  311  1e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  33.21 
 
 		 565 aa  310  4e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  38.63 
 
 		 553 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  36.22 
 
 		 588 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  35.79 
 
 		 552 aa  306  5.0000000000000004e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  38.06 
 
 		 553 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  35.43 
 
 		 561 aa  301  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 573 aa  301  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  34.94 
 
 		 554 aa  300  5e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  33.61 
 
 		 605 aa  296  5e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  32.57 
 
 		 562 aa  296  1e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  34.83 
 
 		 560 aa  294  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  35.02 
 
 		 556 aa  294  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  36.7 
 
 		 561 aa  292  9e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0354  DNA repair protein RecN  36.9 
 
 		 542 aa  292  1e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  33.8 
 
 		 574 aa  290  7e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  32.86 
 
 		 551 aa  288  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1027  DNA repair protein RecN  31.79 
 
 		 562 aa  286  5e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  34.5 
 
 		 572 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  35.27 
 
 		 574 aa  286  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  34.57 
 
 		 582 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  36.28 
 
 		 564 aa  282  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  34.35 
 
 		 575 aa  282  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  31.87 
 
 		 559 aa  282  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  35.46 
 
 		 569 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  38.08 
 
 		 551 aa  281  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0877  DNA repair protein RecN  33.46 
 
 		 552 aa  280  4e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 575 aa  280  7e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  33.74 
 
 		 569 aa  279  8e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  34.98 
 
 		 546 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  34.24 
 
 		 578 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  35.18 
 
 		 554 aa  277  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  35.36 
 
 		 567 aa  277  3e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  32.68 
 
 		 557 aa  276  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 567 aa  276  8e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  34.98 
 
 		 546 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  32.62 
 
 		 551 aa  274  3e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0644  DNA repair protein RecN  34.4 
 
 		 592 aa  273  5.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.659362  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  35.68 
 
 		 553 aa  273  6e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  31.43 
 
 		 577 aa  273  6e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  35.35 
 
 		 546 aa  272  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  33.8 
 
 		 552 aa  271  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1612  DNA repair protein RecN  36 
 
 		 573 aa  271  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.458504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 558 aa  270  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  33.91 
 
 		 568 aa  269  8e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  32.5 
 
 		 557 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  33.09 
 
 		 556 aa  268  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  32.91 
 
 		 552 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  32.74 
 
 		 608 aa  268  2e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  32.74 
 
 		 556 aa  267  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  32.5 
 
 		 570 aa  268  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  34.01 
 
 		 586 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  31.77 
 
 		 574 aa  266  5.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  34.18 
 
 		 586 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  32.91 
 
 		 552 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  34.18 
 
 		 549 aa  266  7e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  32.38 
 
 		 553 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>