61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1770 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  100 
 
 
459 aa  942    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  80.83 
 
 
478 aa  759    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  50 
 
 
459 aa  455  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  44.74 
 
 
451 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  39.95 
 
 
435 aa  273  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  28.77 
 
 
429 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  27.41 
 
 
465 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  28.01 
 
 
378 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  27.29 
 
 
408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  25.98 
 
 
465 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  27.6 
 
 
428 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  26.32 
 
 
466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  27.97 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  27.25 
 
 
457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  26.46 
 
 
391 aa  106  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  42.86 
 
 
224 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  38.66 
 
 
369 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  24.12 
 
 
368 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  36.24 
 
 
378 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  28.1 
 
 
363 aa  96.7  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  36.43 
 
 
377 aa  96.3  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  44.07 
 
 
374 aa  94.7  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  31.46 
 
 
527 aa  90.5  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  27.2 
 
 
467 aa  85.9  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  37.61 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  32.95 
 
 
617 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  40 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  32.41 
 
 
510 aa  79  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  37.23 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  26.74 
 
 
508 aa  75.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  34.78 
 
 
514 aa  73.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  26.29 
 
 
374 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  50 
 
 
461 aa  71.2  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  26.92 
 
 
483 aa  70.5  0.00000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  34.56 
 
 
565 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  49.3 
 
 
457 aa  60.8  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  35.9 
 
 
513 aa  57.4  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1538  hypothetical protein  26.4 
 
 
476 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  30.19 
 
 
595 aa  55.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  36.99 
 
 
555 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3383  hypothetical protein  38.24 
 
 
456 aa  54.3  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  22.04 
 
 
398 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  36.36 
 
 
460 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  36.36 
 
 
460 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2348  hypothetical protein  28.95 
 
 
461 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1940  hypothetical protein  38.89 
 
 
419 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.34914  hitchhiker  0.0000000111377 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1118  hypothetical protein  28.77 
 
 
419 aa  48.9  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.146528  hitchhiker  0.0000000167216 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  35.19 
 
 
355 aa  47.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0135  hypothetical protein  36.49 
 
 
96 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.203  normal  0.0435696 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  42.31 
 
 
496 aa  47  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1861  hypothetical protein  33.05 
 
 
332 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.61669 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  30.26 
 
 
584 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0026  hypothetical protein  41.18 
 
 
398 aa  44.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0471  hypothetical protein  33.65 
 
 
533 aa  44.7  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0692558  decreased coverage  0.00000000612882 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1317  hypothetical protein  30.53 
 
 
388 aa  44.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.361107  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  36.07 
 
 
397 aa  44.7  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  27.34 
 
 
367 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  30 
 
 
364 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  27.34 
 
 
367 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1517  hypothetical protein  44.26 
 
 
556 aa  43.5  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.019243  normal  0.812738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.84 
 
 
669 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>